More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1524 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1524  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 326 aa  657    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  39.18 
 
 		 342 aa  242  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  39.12 
 
 		 349 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  39.12 
 
 		 349 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  40.13 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  38.8 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  40.06 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  39.51 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  38.49 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  36.81 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  37.88 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  38.91 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  38.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  38.18 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0018  ferric cations import ATP-binding protein FbpC 1  43.99 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  38.75 
 
 		 369 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  38.87 
 
 		 343 aa  232  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  38.59 
 
 		 349 aa  232  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  38.89 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  34.76 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  36.61 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  37.89 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  36.54 
 
 		 361 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  40 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 		 353 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  36.2 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  36.31 
 
 		 369 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  39.23 
 
 		 369 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 		 343 aa  225  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 		 349 aa  225  7e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  38.6 
 
 		 356 aa  225  9e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 330 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  35.6 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  37.58 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  35.65 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  35.05 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  44.17 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  44.35 
 
 		 369 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  41.39 
 
 		 329 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  41.08 
 
 		 389 aa  222  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  42.21 
 
 		 358 aa  222  7e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  36.01 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  43.73 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 330 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  35.33 
 
 		 375 aa  220  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0122  ABC transporter related  35.67 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.14 
 
 		 329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  35.17 
 
 		 359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  42.67 
 
 		 342 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  36.57 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  34.85 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  44.77 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  39.57 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  45.61 
 
 		 356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  43.93 
 
 		 352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  36.36 
 
 		 364 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 		 350 aa  215  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  38.4 
 
 		 358 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  44.96 
 
 		 360 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  35.19 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.63 
 
 		 331 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  33.63 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  38.4 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  39.14 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  35.03 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  41.06 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  39.69 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  41.22 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  32.94 
 
 		 365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 		 354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  44.35 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  40.78 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  34.71 
 
 		 349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.09 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  39.06 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  41.84 
 
 		 357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  42.26 
 
 		 364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  44.35 
 
 		 353 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3233  ABC transporter related  29.76 
 
 		 344 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.611679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  37.38 
 
 		 358 aa  212  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  36.58 
 
 		 355 aa  212  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  33.12 
 
 		 352 aa  212  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  32.95 
 
 		 369 aa  212  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  40.42 
 
 		 355 aa  212  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  38.2 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  41.46 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  38.31 
 
 		 363 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>