More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0453 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  100 
 
 
347 aa  703    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  68.59 
 
 
371 aa  454  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  63.51 
 
 
369 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  59.26 
 
 
355 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  60.86 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  57.91 
 
 
357 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  58.09 
 
 
375 aa  403  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  57.27 
 
 
361 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  56.4 
 
 
368 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  56.2 
 
 
348 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  57.49 
 
 
357 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  56.09 
 
 
361 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  57.14 
 
 
369 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  55.85 
 
 
353 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  54.93 
 
 
386 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  56.21 
 
 
358 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  53.06 
 
 
355 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  56.5 
 
 
358 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  56.59 
 
 
369 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  54.93 
 
 
365 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  55.85 
 
 
369 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  55.39 
 
 
369 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  55.1 
 
 
369 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  55.52 
 
 
354 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  51.45 
 
 
358 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  54.23 
 
 
369 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  51.74 
 
 
376 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  54.08 
 
 
410 aa  358  7e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  52.89 
 
 
353 aa  353  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  52.41 
 
 
356 aa  351  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  55.26 
 
 
360 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  51.16 
 
 
355 aa  342  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  54.68 
 
 
360 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  53.19 
 
 
389 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  47.28 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  49.3 
 
 
415 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1726  ABC transporter related  50 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.350865 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 
343 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  62.18 
 
 
257 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  62.14 
 
 
257 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  61.32 
 
 
257 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  61.32 
 
 
257 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  60.91 
 
 
257 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  60.49 
 
 
257 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  61.34 
 
 
257 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.49 
 
 
259 aa  292  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  42.65 
 
 
343 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  46.15 
 
 
389 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  45.85 
 
 
377 aa  289  4e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 
343 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  42.65 
 
 
349 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.14 
 
 
346 aa  281  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  46.99 
 
 
378 aa  281  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  42.23 
 
 
343 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  42.07 
 
 
349 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
349 aa  279  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  42.49 
 
 
349 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  41.79 
 
 
349 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  42.27 
 
 
342 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.79 
 
 
349 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  42.65 
 
 
349 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  42.36 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  40.92 
 
 
349 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  43.93 
 
 
360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 
256 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  60.08 
 
 
256 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 
256 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 
256 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 
256 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.08 
 
 
256 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  59.67 
 
 
256 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  41.35 
 
 
342 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  41.35 
 
 
342 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  43.6 
 
 
342 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  40.47 
 
 
342 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  40.88 
 
 
350 aa  263  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
341 aa  263  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  45.86 
 
 
346 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  45.1 
 
 
342 aa  261  8.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  45 
 
 
368 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  42.46 
 
 
378 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  42.82 
 
 
366 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  44.08 
 
 
357 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  45.2 
 
 
360 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  45.2 
 
 
360 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  47.56 
 
 
373 aa  256  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  44.17 
 
 
352 aa  255  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  39.77 
 
 
361 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  44.74 
 
 
355 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
349 aa  253  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  44.41 
 
 
371 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.98 
 
 
384 aa  252  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.17 
 
 
349 aa  251  9.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  42.38 
 
 
389 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.08 
 
 
352 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.3 
 
 
368 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  39.77 
 
 
361 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  39.89 
 
 
366 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  43.09 
 
 
379 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>