More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1062 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  100 
 
 
373 aa  733    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  74.47 
 
 
387 aa  556  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  61.47 
 
 
389 aa  432  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  59.14 
 
 
377 aa  427  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  62.09 
 
 
378 aa  422  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  49.29 
 
 
1057 aa  344  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  47.59 
 
 
368 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  46.07 
 
 
359 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  43.14 
 
 
357 aa  296  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  49.7 
 
 
342 aa  296  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  49.13 
 
 
354 aa  295  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  45.27 
 
 
369 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  47.28 
 
 
347 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  48.04 
 
 
355 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  46.86 
 
 
369 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  46.47 
 
 
369 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  44.41 
 
 
369 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  45.74 
 
 
355 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  48.22 
 
 
357 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  44.41 
 
 
369 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  43.43 
 
 
358 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  45.87 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  55.33 
 
 
374 aa  285  9e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  45.2 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  44.89 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  48.97 
 
 
368 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  44.07 
 
 
342 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
353 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  46.09 
 
 
365 aa  280  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  45.27 
 
 
361 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  49.22 
 
 
368 aa  277  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  48.15 
 
 
356 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  42.5 
 
 
360 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  42.5 
 
 
360 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  41.5 
 
 
366 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  44.54 
 
 
386 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  42.94 
 
 
360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  47.53 
 
 
349 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  47.55 
 
 
342 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
342 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  45.43 
 
 
361 aa  272  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  44.38 
 
 
410 aa  272  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  43.72 
 
 
390 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  41.76 
 
 
378 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  46.32 
 
 
366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.31 
 
 
346 aa  270  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  44.32 
 
 
375 aa  270  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  41.64 
 
 
367 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  39.02 
 
 
352 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.99 
 
 
370 aa  269  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  43.14 
 
 
355 aa  269  7e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  51.1 
 
 
352 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  38.39 
 
 
376 aa  267  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  41.33 
 
 
348 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
349 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  44.74 
 
 
358 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  45.27 
 
 
346 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  44.74 
 
 
358 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  45.19 
 
 
363 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  45.03 
 
 
352 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  42.41 
 
 
349 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  50 
 
 
352 aa  264  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  48.82 
 
 
360 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  47.11 
 
 
365 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  41.85 
 
 
349 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  47.11 
 
 
360 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  41.26 
 
 
349 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  47.4 
 
 
360 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  42.12 
 
 
349 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  47.95 
 
 
353 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  42.9 
 
 
356 aa  263  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  36.95 
 
 
352 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  42.49 
 
 
344 aa  263  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  41.35 
 
 
342 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  44.32 
 
 
362 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  40.66 
 
 
352 aa  262  8e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  45.86 
 
 
359 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.21 
 
 
382 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  46.06 
 
 
371 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 
349 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  40.97 
 
 
349 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  44.26 
 
 
353 aa  260  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.32 
 
 
352 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.08 
 
 
363 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  46.55 
 
 
364 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  47.06 
 
 
357 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  43.48 
 
 
361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  40.97 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  40.54 
 
 
386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  44.07 
 
 
343 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.34 
 
 
353 aa  258  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  40.69 
 
 
349 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.66 
 
 
402 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  40.93 
 
 
369 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 
343 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.8 
 
 
408 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.8 
 
 
368 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  40.07 
 
 
352 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  43.75 
 
 
353 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  45.12 
 
 
353 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>