More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3633 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  100 
 
 
349 aa  712    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  98.57 
 
 
349 aa  703    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  99.14 
 
 
349 aa  706    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  89.11 
 
 
349 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  99.43 
 
 
349 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  86.25 
 
 
349 aa  624  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  87.39 
 
 
349 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  86.82 
 
 
349 aa  624  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  86.53 
 
 
349 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  68.12 
 
 
342 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  67.44 
 
 
342 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  67.54 
 
 
342 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  66.38 
 
 
342 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  65.61 
 
 
343 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  60.29 
 
 
341 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  48.7 
 
 
343 aa  342  7e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
346 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  47.26 
 
 
343 aa  332  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  48.57 
 
 
350 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  50.56 
 
 
349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  45.53 
 
 
343 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  45.95 
 
 
361 aa  286  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  43.14 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  45.54 
 
 
361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  42.09 
 
 
357 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  41.31 
 
 
361 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.07 
 
 
347 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  47 
 
 
354 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  44.02 
 
 
369 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  47.18 
 
 
342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
387 aa  273  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  41.11 
 
 
355 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  44.31 
 
 
369 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  42.12 
 
 
389 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  43.6 
 
 
369 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  45.74 
 
 
366 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  43.44 
 
 
369 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  43.71 
 
 
360 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  43.71 
 
 
360 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  40.68 
 
 
375 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  42.03 
 
 
369 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  49.29 
 
 
355 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
369 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  43.73 
 
 
368 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  43.67 
 
 
354 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  43.2 
 
 
378 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  42.73 
 
 
358 aa  262  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  42.73 
 
 
358 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  46.76 
 
 
342 aa  262  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  39.24 
 
 
358 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
371 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  42.45 
 
 
386 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  42.94 
 
 
357 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1014  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 
372 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  40.23 
 
 
355 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  38.62 
 
 
348 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  40.62 
 
 
359 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  42.2 
 
 
365 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  40.17 
 
 
377 aa  256  5e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  40.63 
 
 
353 aa  256  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  41.76 
 
 
373 aa  255  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 
353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  48.87 
 
 
376 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  40.16 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0015  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 
365 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 
357 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  43.87 
 
 
346 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  44.11 
 
 
356 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  49.64 
 
 
352 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  40.17 
 
 
361 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  41.03 
 
 
360 aa  249  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  43.4 
 
 
368 aa  249  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.17 
 
 
365 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.051022  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  40.92 
 
 
410 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1019  ABC transporter related  41.37 
 
 
354 aa  245  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  41.43 
 
 
347 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  46.69 
 
 
365 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  38.68 
 
 
348 aa  242  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  40.67 
 
 
364 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1524  ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 
326 aa  240  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.08 
 
 
359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 
348 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  42.81 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.06 
 
 
352 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  45.16 
 
 
370 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  37.71 
 
 
353 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.23 
 
 
356 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  37.46 
 
 
349 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  42.01 
 
 
333 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  39.66 
 
 
378 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4066  ABC transporter related  37.74 
 
 
379 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549495  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  39.17 
 
 
348 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  38.94 
 
 
349 aa  236  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  42.77 
 
 
356 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  40.6 
 
 
347 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.26 
 
 
377 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  34.16 
 
 
367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  47.53 
 
 
1057 aa  235  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  41.29 
 
 
357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>