More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0139 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 343 aa  704    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  78.43 
 
 		 343 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  78.43 
 
 		 343 aa  567  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  61.11 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  48.7 
 
 		 349 aa  347  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  48.7 
 
 		 349 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  48.7 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  49.85 
 
 		 342 aa  339  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  49.12 
 
 		 342 aa  338  8e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  48.13 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  48.13 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 		 349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  48.08 
 
 		 342 aa  334  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  49.41 
 
 		 343 aa  334  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  50.45 
 
 		 342 aa  333  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  47.13 
 
 		 349 aa  332  8e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  47.55 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  47.26 
 
 		 349 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.11 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 		 341 aa  308  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  44.96 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  43.67 
 
 		 361 aa  291  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  46.65 
 
 		 366 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  43.37 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  40.87 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  42.15 
 
 		 358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  41.69 
 
 		 357 aa  286  4e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.19 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  41.88 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  41.06 
 
 		 361 aa  278  7e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 369 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  44.44 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  42.94 
 
 		 369 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  43.1 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  42.49 
 
 		 375 aa  276  5e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 353 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  42.36 
 
 		 369 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  45.42 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  43.35 
 
 		 368 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  42.51 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  40.29 
 
 		 348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  39 
 
 		 355 aa  268  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  42.65 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  42.56 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  40.45 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  39.32 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  40.29 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  40.29 
 
 		 359 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  53.16 
 
 		 257 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 		 343 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  40.23 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1019  ABC transporter related  40.71 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  39.94 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  45.06 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  41.26 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  45.06 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  49.64 
 
 		 405 aa  256  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  39.02 
 
 		 389 aa  255  6e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  44.25 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  41.62 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  53.16 
 
 		 257 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  53.16 
 
 		 257 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  52.74 
 
 		 257 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  36.59 
 
 		 367 aa  252  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  39.43 
 
 		 361 aa  252  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  40.23 
 
 		 371 aa  252  7e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  52.32 
 
 		 257 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.9 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  51.48 
 
 		 257 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.08 
 
 		 259 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  42.44 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  40.29 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1014  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  42.82 
 
 		 347 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  38.1 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  43.23 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  51.48 
 
 		 257 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  39.71 
 
 		 347 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0122  ABC transporter related  38.23 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  41.83 
 
 		 346 aa  246  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  45.58 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.41 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.42 
 
 		 329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  41 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  44.19 
 
 		 379 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  40.79 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  41.29 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  39.54 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.47 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  42.76 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  40.7 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  40 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.44 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.06 
 
 		 353 aa  242  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  39.38 
 
 		 358 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  39.29 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  41.04 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.58 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>