More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0701 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 
367 aa  747    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  99.46 
 
 
367 aa  741    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  70.03 
 
 
364 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  47.58 
 
 
365 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  48.28 
 
 
363 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  45.93 
 
 
373 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  52.01 
 
 
362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  41.21 
 
 
372 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  43.65 
 
 
367 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6287  ABC transporter related  46.49 
 
 
349 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  44.93 
 
 
373 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  45.82 
 
 
370 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  46.1 
 
 
342 aa  262  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  44.74 
 
 
387 aa  260  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  48.72 
 
 
375 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  42.25 
 
 
366 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  47.16 
 
 
371 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  48.2 
 
 
364 aa  256  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  43.26 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  41.91 
 
 
377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  45.79 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0569  ABC transporter related  45.79 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569114  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  45.6 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  48.2 
 
 
355 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  43.58 
 
 
368 aa  250  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  45.98 
 
 
378 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  44.62 
 
 
346 aa  245  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  44.77 
 
 
378 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  43.45 
 
 
375 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.79 
 
 
349 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  42.02 
 
 
353 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  40.69 
 
 
342 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  41.69 
 
 
342 aa  242  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  46.76 
 
 
378 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  40.97 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 
353 aa  239  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  42.43 
 
 
349 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  46.76 
 
 
378 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  42.43 
 
 
349 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
349 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  42.86 
 
 
349 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.11 
 
 
368 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  39.6 
 
 
348 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
353 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  40 
 
 
360 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  42.86 
 
 
349 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  42.11 
 
 
349 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  42.86 
 
 
349 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  44.12 
 
 
353 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.94 
 
 
362 aa  236  6e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.72 
 
 
373 aa  236  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  45.8 
 
 
359 aa  235  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 
341 aa  236  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  42.38 
 
 
349 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  43.77 
 
 
379 aa  235  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  46.71 
 
 
384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.84 
 
 
353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  42.57 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  37.94 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  42.28 
 
 
368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  42.05 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  42.38 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 
353 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  44.25 
 
 
362 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  41.31 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  43.38 
 
 
368 aa  232  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  43.28 
 
 
351 aa  232  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  42.26 
 
 
359 aa  232  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.03 
 
 
352 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0872  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40 
 
 
385 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  43.09 
 
 
369 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  43.79 
 
 
353 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  47.49 
 
 
360 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  40.59 
 
 
347 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  47.49 
 
 
360 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  41.25 
 
 
349 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  46.86 
 
 
333 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 
356 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  42.01 
 
 
357 aa  229  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  42.27 
 
 
364 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.98 
 
 
355 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  46.75 
 
 
353 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  41.64 
 
 
363 aa  229  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  40.41 
 
 
363 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  42.39 
 
 
353 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  39.04 
 
 
374 aa  229  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  41.85 
 
 
353 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  40.45 
 
 
361 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  42.77 
 
 
353 aa  229  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  40.38 
 
 
364 aa  229  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  38.36 
 
 
353 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0826  ABC transporter related  43.69 
 
 
357 aa  228  9e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 
343 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  39.94 
 
 
346 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.94 
 
 
373 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  45.1 
 
 
373 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  46.99 
 
 
390 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  40.74 
 
 
396 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>