More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6287 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6287  ABC transporter related  100 
 
 
349 aa  668    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  67.84 
 
 
370 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0569  ABC transporter related  66.37 
 
 
391 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569114  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  66.37 
 
 
352 aa  391  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  58.77 
 
 
365 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  57.44 
 
 
363 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  49.85 
 
 
373 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.49 
 
 
367 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.2 
 
 
367 aa  275  8e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  49.21 
 
 
357 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  44.38 
 
 
364 aa  248  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  48.35 
 
 
389 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  47.23 
 
 
367 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  44.12 
 
 
342 aa  235  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  40.88 
 
 
360 aa  232  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.81 
 
 
352 aa  232  8.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  44.88 
 
 
372 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.48 
 
 
363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  46.1 
 
 
375 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  42.09 
 
 
349 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  41.79 
 
 
349 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  41.79 
 
 
349 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  40.8 
 
 
371 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  40.29 
 
 
362 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.79 
 
 
349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  42.26 
 
 
359 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  50.55 
 
 
355 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  41.69 
 
 
378 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  42.86 
 
 
368 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  41.09 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.64 
 
 
387 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  38.74 
 
 
349 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  45.19 
 
 
373 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  41.09 
 
 
378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.32 
 
 
370 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  38.94 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  44.03 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  37.02 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  39.83 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  41.79 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  39.66 
 
 
353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  48.36 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  38.64 
 
 
389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.11 
 
 
360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.17 
 
 
341 aa  212  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  38.18 
 
 
366 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  42.43 
 
 
342 aa  212  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.12 
 
 
362 aa  211  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  40.06 
 
 
348 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  40.43 
 
 
339 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  40.77 
 
 
369 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  40.12 
 
 
349 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0965  ABC transporter related  44.14 
 
 
343 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.612494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  40.12 
 
 
369 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  47.01 
 
 
364 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  40.72 
 
 
337 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  39.14 
 
 
353 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  40.4 
 
 
375 aa  209  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  39.94 
 
 
364 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  38.59 
 
 
356 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  38.92 
 
 
405 aa  209  8e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  37.46 
 
 
357 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 
349 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  39.77 
 
 
357 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  46.38 
 
 
384 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  42.31 
 
 
348 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  40.45 
 
 
356 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.36 
 
 
355 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6023  ABC transporter-related protein  38.11 
 
 
367 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  39.53 
 
 
369 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0018  ferric cations import ATP-binding protein FbpC 1  35.74 
 
 
319 aa  206  5e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  43.16 
 
 
349 aa  206  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  39.52 
 
 
349 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  38.87 
 
 
356 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  38.27 
 
 
340 aa  205  8e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  43.49 
 
 
343 aa  205  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 
353 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.94 
 
 
353 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  40 
 
 
359 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  38.95 
 
 
369 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  40.18 
 
 
365 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  42.18 
 
 
346 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  37.03 
 
 
348 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  41.67 
 
 
347 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  39.13 
 
 
349 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  42.18 
 
 
346 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 
353 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  45.96 
 
 
346 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  39.94 
 
 
342 aa  204  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  42.18 
 
 
346 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.56 
 
 
366 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 
340 aa  204  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  35.65 
 
 
349 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  41.16 
 
 
344 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  40.43 
 
 
342 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.07 
 
 
377 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  41.58 
 
 
336 aa  203  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  45.96 
 
 
349 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  40.6 
 
 
357 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  41.84 
 
 
347 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>