More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5748 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  100 
 
 
364 aa  724    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  94.1 
 
 
359 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  74.13 
 
 
349 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  74.13 
 
 
349 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  74.13 
 
 
349 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  52.43 
 
 
396 aa  341  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  51.08 
 
 
398 aa  331  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  52.48 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  50.86 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  51.61 
 
 
344 aa  322  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  50.73 
 
 
345 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  48.99 
 
 
348 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  48.26 
 
 
344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  47.41 
 
 
349 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 
349 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  47.41 
 
 
349 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  48.44 
 
 
356 aa  299  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  47.4 
 
 
345 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
346 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  55.94 
 
 
384 aa  295  9e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  49.43 
 
 
350 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  51.01 
 
 
357 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  49.86 
 
 
351 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 
349 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  51.49 
 
 
342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  44.41 
 
 
352 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  47.77 
 
 
342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  46.97 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  46.26 
 
 
352 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  49.51 
 
 
333 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  45.07 
 
 
352 aa  260  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  45.43 
 
 
363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  47.43 
 
 
364 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  43.47 
 
 
359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  48.42 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.54 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  43.25 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
354 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.95 
 
 
355 aa  245  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  50.33 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  40.93 
 
 
387 aa  243  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  48.39 
 
 
345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.41 
 
 
402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  41.69 
 
 
378 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  42.55 
 
 
366 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  44.51 
 
 
374 aa  238  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  52.32 
 
 
353 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  46.79 
 
 
352 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  45.11 
 
 
374 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 
353 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  46.82 
 
 
360 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.83 
 
 
372 aa  235  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.79 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  46.29 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 
353 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  39.36 
 
 
373 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  44.26 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  42.68 
 
 
389 aa  233  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.6 
 
 
373 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
341 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  51.68 
 
 
352 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  43.08 
 
 
352 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 
356 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.4 
 
 
377 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.27 
 
 
367 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.64 
 
 
341 aa  228  9e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
367 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.95 
 
 
366 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  38.07 
 
 
342 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  43.93 
 
 
527 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  43.73 
 
 
365 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.84 
 
 
377 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.84 
 
 
377 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.22 
 
 
370 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.84 
 
 
377 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 
378 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.28 
 
 
388 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  41.85 
 
 
352 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  47.45 
 
 
390 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  38.66 
 
 
353 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.43 
 
 
352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 
352 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2917  ABC transporter-like protein  43.88 
 
 
351 aa  226  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.83 
 
 
384 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.13 
 
 
381 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.01 
 
 
366 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 
365 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6838  putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 
393 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.840617  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.31 
 
 
371 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  45.42 
 
 
350 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.67 
 
 
367 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  42.81 
 
 
378 aa  225  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.6 
 
 
378 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.95 
 
 
359 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  43.69 
 
 
363 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.18 
 
 
346 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  44.92 
 
 
386 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  43.12 
 
 
375 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  43.21 
 
 
353 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.16 
 
 
381 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>