More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2428 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  100 
 
 
344 aa  682    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  74.42 
 
 
344 aa  508  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  69.39 
 
 
345 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  63.98 
 
 
349 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  63.98 
 
 
349 aa  448  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  63.98 
 
 
349 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  55.81 
 
 
356 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
346 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  55.46 
 
 
350 aa  358  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  55.07 
 
 
345 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  53.91 
 
 
345 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  51.4 
 
 
396 aa  331  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  51.13 
 
 
398 aa  325  7e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  49.71 
 
 
348 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  55.4 
 
 
359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  48.26 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  55.6 
 
 
349 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  55.6 
 
 
349 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  55.6 
 
 
349 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
357 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  47.95 
 
 
349 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  46.82 
 
 
350 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  50.18 
 
 
384 aa  260  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  46.73 
 
 
352 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  46.73 
 
 
352 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  49.69 
 
 
345 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  43.51 
 
 
342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  46.57 
 
 
342 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  48.75 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  48 
 
 
333 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  44.61 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  48.08 
 
 
353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  43.37 
 
 
364 aa  232  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  44.4 
 
 
371 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  44.04 
 
 
375 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  45.58 
 
 
355 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  43.68 
 
 
362 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  42.06 
 
 
364 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  38.51 
 
 
342 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  47.7 
 
 
352 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  50.21 
 
 
387 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  39.66 
 
 
356 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  42.91 
 
 
373 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.24 
 
 
353 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  38.34 
 
 
342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
353 aa  222  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  41.64 
 
 
363 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  47.27 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  40.23 
 
 
361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.23 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  44.77 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  43.5 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  41.87 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  44.97 
 
 
352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  44.77 
 
 
378 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 
353 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  41.06 
 
 
366 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
387 aa  219  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  35.76 
 
 
367 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  38.76 
 
 
366 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.87 
 
 
363 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.79 
 
 
359 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.26 
 
 
367 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  41.61 
 
 
389 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  40.52 
 
 
362 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1077  ABC transporter related  46.72 
 
 
382 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.71 
 
 
355 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  42.24 
 
 
364 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.37 
 
 
370 aa  216  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 
367 aa  215  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  34.88 
 
 
360 aa  215  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  38.41 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.19 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.43 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  43.28 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  43.1 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  41.34 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 
350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  43.23 
 
 
353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  39.58 
 
 
342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.02 
 
 
353 aa  212  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  40.25 
 
 
377 aa  212  7.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  44.44 
 
 
368 aa  211  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  40.95 
 
 
352 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  43.64 
 
 
349 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  39.65 
 
 
342 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  42.31 
 
 
330 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  42.23 
 
 
348 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  44.48 
 
 
370 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  40.46 
 
 
359 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.26 
 
 
359 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
349 aa  210  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.23 
 
 
348 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 
378 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.7 
 
 
378 aa  209  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  42.86 
 
 
373 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  41.16 
 
 
353 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  42.91 
 
 
349 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  45.7 
 
 
343 aa  209  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 
354 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>