More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1903 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  100 
 
 
343 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  90.67 
 
 
343 aa  625  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  69.58 
 
 
355 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  66.57 
 
 
356 aa  481  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  67.04 
 
 
365 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  65.01 
 
 
355 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  65.53 
 
 
359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  63.35 
 
 
354 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.39 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.5 
 
 
354 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 
357 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  64.33 
 
 
360 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  60.68 
 
 
357 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.45 
 
 
354 aa  435  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.52 
 
 
375 aa  428  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  62.22 
 
 
362 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.52 
 
 
375 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.65 
 
 
375 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.36 
 
 
362 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.19 
 
 
355 aa  418  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.22 
 
 
357 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.14 
 
 
374 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  62.46 
 
 
348 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  61.81 
 
 
352 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  58.74 
 
 
367 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.51 
 
 
371 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.61 
 
 
329 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.55 
 
 
369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.71 
 
 
369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.71 
 
 
369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.61 
 
 
329 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  58.22 
 
 
378 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.25 
 
 
351 aa  401  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.54 
 
 
332 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.01 
 
 
329 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  58.43 
 
 
372 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.01 
 
 
329 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  58.76 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  60.3 
 
 
329 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  59.59 
 
 
326 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  59.59 
 
 
326 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  61.08 
 
 
323 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.19 
 
 
365 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  60 
 
 
329 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  56.3 
 
 
357 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.06 
 
 
359 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 
351 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 
351 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 
351 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 
351 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 
351 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 
351 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 
351 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  57.74 
 
 
329 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  59.31 
 
 
351 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  58 
 
 
352 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.81 
 
 
363 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58 
 
 
352 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.49 
 
 
353 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.85 
 
 
330 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  59.14 
 
 
349 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.14 
 
 
352 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.14 
 
 
352 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.73 
 
 
330 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  58.57 
 
 
352 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  57.26 
 
 
349 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  58.86 
 
 
352 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.86 
 
 
352 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.86 
 
 
352 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.27 
 
 
330 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.56 
 
 
330 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.58 
 
 
353 aa  375  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58 
 
 
352 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  55.69 
 
 
338 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  57.31 
 
 
348 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.94 
 
 
376 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  57.88 
 
 
348 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.71 
 
 
374 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 
376 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 
376 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 
376 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 
376 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  55.78 
 
 
338 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2197  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.2 
 
 
359 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  55.1 
 
 
338 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  58.05 
 
 
345 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.41 
 
 
376 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.11 
 
 
373 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3602  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 
376 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.91 
 
 
338 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.59 
 
 
348 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0649  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.65 
 
 
373 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.13 
 
 
376 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.13 
 
 
376 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.36 
 
 
346 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  55.75 
 
 
349 aa  362  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.76 
 
 
351 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.01 
 
 
332 aa  355  5.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.4 
 
 
336 aa  355  7.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  56.5 
 
 
356 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>