More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2856 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  707    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  94.1 
 
 
364 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  74.71 
 
 
349 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  74.71 
 
 
349 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  74.71 
 
 
349 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  53.21 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  51.19 
 
 
398 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  53.06 
 
 
345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  51.91 
 
 
344 aa  324  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  50.86 
 
 
350 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  51.9 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  49.43 
 
 
348 aa  309  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  55.4 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  48.44 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  48.55 
 
 
345 aa  302  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  47.99 
 
 
349 aa  302  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  47.99 
 
 
349 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
346 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.99 
 
 
349 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  55.75 
 
 
384 aa  292  8e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  49.13 
 
 
350 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  50.85 
 
 
357 aa  285  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  50.14 
 
 
349 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  49.57 
 
 
351 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  51.47 
 
 
342 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  47.77 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  46.97 
 
 
346 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  44.41 
 
 
352 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  50.65 
 
 
333 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
352 aa  262  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  46.42 
 
 
363 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  48.84 
 
 
364 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  45.98 
 
 
352 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  50.82 
 
 
364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  43.23 
 
 
366 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  43.03 
 
 
359 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  48.14 
 
 
353 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.59 
 
 
355 aa  249  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.11 
 
 
402 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  43.34 
 
 
355 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.31 
 
 
354 aa  246  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  45.53 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.72 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  41.98 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  47.52 
 
 
352 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  42.9 
 
 
387 aa  242  7e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  53.59 
 
 
353 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  48.09 
 
 
345 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  47.45 
 
 
360 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.66 
 
 
370 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 
353 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  45.51 
 
 
374 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  49.19 
 
 
352 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  43.63 
 
 
389 aa  236  4e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  38.97 
 
 
342 aa  236  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  46.64 
 
 
361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.58 
 
 
353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.34 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.36 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.8 
 
 
341 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.62 
 
 
378 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.29 
 
 
353 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.41 
 
 
377 aa  232  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.41 
 
 
377 aa  232  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.41 
 
 
377 aa  232  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.79 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  40.41 
 
 
373 aa  232  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2917  ABC transporter-like protein  44.11 
 
 
351 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  45.45 
 
 
365 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.78 
 
 
380 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.94 
 
 
352 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.09 
 
 
373 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  45.08 
 
 
363 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  44.67 
 
 
378 aa  229  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 
348 aa  229  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.19 
 
 
379 aa  229  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.41 
 
 
400 aa  229  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  44.07 
 
 
377 aa  229  8e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.83 
 
 
372 aa  228  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.13 
 
 
372 aa  228  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  45.79 
 
 
350 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.53 
 
 
378 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.99 
 
 
375 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.53 
 
 
378 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.53 
 
 
378 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  43.52 
 
 
352 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.92 
 
 
366 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  46.18 
 
 
341 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.2 
 
 
378 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.32 
 
 
367 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.2 
 
 
378 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.2 
 
 
378 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.2 
 
 
378 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.2 
 
 
378 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.02 
 
 
381 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.2 
 
 
378 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  40.2 
 
 
378 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.77 
 
 
356 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.49 
 
 
357 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  41.64 
 
 
352 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>