More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2539 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 378 aa  755    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  91.08 
 
 		 371 aa  674    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  99.74 
 
 		 378 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  72.68 
 
 		 362 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  69.97 
 
 		 364 aa  501  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  65.59 
 
 		 375 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  53.21 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  46.8 
 
 		 389 aa  299  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  45.07 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  44.54 
 
 		 367 aa  282  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  46.67 
 
 		 365 aa  275  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  45.35 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  43.02 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  43.58 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  45.51 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 387 aa  255  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  39.94 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.76 
 
 		 367 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  41.9 
 
 		 353 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  43.33 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.6 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  43.58 
 
 		 342 aa  250  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  42.39 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.81 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.81 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.81 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  40.91 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  45.09 
 
 		 346 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.08 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  46.81 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  36.9 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0569  ABC transporter related  43.28 
 
 		 391 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  40.95 
 
 		 366 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  39.37 
 
 		 389 aa  245  6.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  43.24 
 
 		 370 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  48.77 
 
 		 347 aa  246  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  41.45 
 
 		 396 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  45.08 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.21 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  39.3 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  43.34 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.16 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  37.32 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  39.13 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2120  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.95 
 
 		 380 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674614  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  40.38 
 
 		 369 aa  239  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  49.79 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  43.53 
 
 		 333 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  39.67 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.03 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.53 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  41.93 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.5 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.26 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0347  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.88 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.03 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688295  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  45.28 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  38.35 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.98 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  41.04 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.83 
 
 		 378 aa  236  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  39.27 
 
 		 383 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.43 
 
 		 380 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.21 
 
 		 377 aa  235  7e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.21 
 
 		 377 aa  235  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5086  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.43 
 
 		 380 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.36 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.21 
 
 		 377 aa  235  8e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  40.44 
 
 		 352 aa  235  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  38.21 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.21 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.21 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  38.21 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.21 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0393  polyamine transport protein PotG  39.53 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.77 
 
 		 331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  47.45 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  39.23 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.21 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.59 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.59 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03940  polyamine transport protein PotG  39.65 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.59 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  39.07 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5239  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.43 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.94 
 
 		 377 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  38.62 
 
 		 369 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  37.78 
 
 		 369 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.07 
 
 		 363 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1263  putrescine transport ATP-binding protein PotG  38.3 
 
 		 381 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  37.5 
 
 		 369 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  44.77 
 
 		 344 aa  232  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  44.37 
 
 		 355 aa  232  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.71 
 
 		 380 aa  232  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  38.94 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  39.28 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>