More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3701 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3701  ABC transporter related  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  68.35 
 
 		 257 aa  305  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  68.35 
 
 		 259 aa  300  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  66.97 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  66.06 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  66.51 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  65.6 
 
 		 257 aa  294  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  65.6 
 
 		 257 aa  294  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  65.14 
 
 		 257 aa  291  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  66.51 
 
 		 256 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  66.51 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  66.51 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  66.51 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  66.51 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  66.51 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  66.06 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  62.73 
 
 		 369 aa  269  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  59.46 
 
 		 357 aa  268  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  59.19 
 
 		 365 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  59.45 
 
 		 386 aa  257  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  61.27 
 
 		 359 aa  255  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1344  ABC transporter related  58.26 
 
 		 227 aa  254  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.274567  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  58.74 
 
 		 354 aa  254  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2991  ABC transporter related protein  57.8 
 
 		 224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  61.27 
 
 		 410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  61 
 
 		 355 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  62.56 
 
 		 376 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  59.55 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  59.55 
 
 		 358 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  55.5 
 
 		 348 aa  250  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  55.86 
 
 		 353 aa  248  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  55.96 
 
 		 361 aa  246  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  60.5 
 
 		 357 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  55.5 
 
 		 369 aa  245  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  56.42 
 
 		 353 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  55.16 
 
 		 368 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  56.76 
 
 		 347 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  55.41 
 
 		 369 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  55.41 
 
 		 369 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  55.91 
 
 		 361 aa  238  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  53.21 
 
 		 358 aa  236  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  54.95 
 
 		 369 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  55.16 
 
 		 355 aa  236  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 		 343 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  56.76 
 
 		 375 aa  236  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  57.43 
 
 		 369 aa  234  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  56.86 
 
 		 369 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  56.31 
 
 		 356 aa  232  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  49.1 
 
 		 343 aa  229  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  56.04 
 
 		 387 aa  229  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 346 aa  229  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  54.3 
 
 		 346 aa  225  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  53.33 
 
 		 390 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  54.31 
 
 		 342 aa  224  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  48.64 
 
 		 342 aa  224  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  52.47 
 
 		 405 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  52.22 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  63.18 
 
 		 389 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  49.09 
 
 		 342 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  54.55 
 
 		 355 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  49.77 
 
 		 378 aa  218  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  48.18 
 
 		 342 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  57.8 
 
 		 371 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  58.5 
 
 		 368 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  52.24 
 
 		 377 aa  215  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  54.05 
 
 		 415 aa  214  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  48.4 
 
 		 360 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1726  ABC transporter related  57.35 
 
 		 372 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.350865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  48.88 
 
 		 366 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  45.95 
 
 		 349 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  48.89 
 
 		 363 aa  211  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  45.5 
 
 		 349 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  55.61 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  55.05 
 
 		 342 aa  209  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 		 352 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  49.25 
 
 		 349 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 341 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  46.36 
 
 		 349 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  51.52 
 
 		 369 aa  208  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 353 aa  208  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0442  putative iron ABC transporter, ATP-binding protein  43.66 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  47.5 
 
 		 342 aa  208  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  45.91 
 
 		 349 aa  208  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  49.25 
 
 		 349 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 353 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 349 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  44.14 
 
 		 352 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  52.74 
 
 		 389 aa  207  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  51.52 
 
 		 364 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  48.74 
 
 		 349 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  53.5 
 
 		 352 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  53.2 
 
 		 357 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  47.93 
 
 		 343 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  47.51 
 
 		 343 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  45.91 
 
 		 349 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51 
 
 		 352 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  52.71 
 
 		 389 aa  205  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  51.61 
 
 		 333 aa  205  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  55.33 
 
 		 352 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>