More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1344 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1344  ABC transporter related  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.274567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2991  ABC transporter related protein  95.98 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3701  ABC transporter related  58.26 
 
 		 228 aa  254  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  57.8 
 
 		 257 aa  254  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  57.8 
 
 		 257 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  56.88 
 
 		 257 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  56.88 
 
 		 257 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  56.88 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  56.88 
 
 		 257 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  56.42 
 
 		 257 aa  245  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.05 
 
 		 259 aa  241  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  54.02 
 
 		 369 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  54.02 
 
 		 369 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  57 
 
 		 357 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  53.21 
 
 		 369 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  53.57 
 
 		 369 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  57.5 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  54.09 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  53.67 
 
 		 353 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  52.47 
 
 		 368 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  54.13 
 
 		 369 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  53.88 
 
 		 361 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  53.67 
 
 		 375 aa  227  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  57.34 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  57.34 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  57.34 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  57.34 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  57.34 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  57.34 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  54.59 
 
 		 347 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.34 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  55.72 
 
 		 410 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  55.72 
 
 		 358 aa  224  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  50 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  55.22 
 
 		 386 aa  222  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  51.13 
 
 		 357 aa  222  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  55.22 
 
 		 358 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  51.82 
 
 		 359 aa  222  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  53.21 
 
 		 348 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  54.82 
 
 		 378 aa  219  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  55.22 
 
 		 354 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  48.85 
 
 		 342 aa  218  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  51.13 
 
 		 365 aa  218  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  49.09 
 
 		 366 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  52.29 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  48.85 
 
 		 342 aa  215  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  53.2 
 
 		 390 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  51.57 
 
 		 355 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  56.78 
 
 		 356 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  47.93 
 
 		 342 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  47.75 
 
 		 358 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  49.31 
 
 		 349 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  53.5 
 
 		 353 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  49.07 
 
 		 349 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  53.81 
 
 		 346 aa  211  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  48.61 
 
 		 349 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  48.61 
 
 		 349 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  49.75 
 
 		 342 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  47.93 
 
 		 343 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  49.02 
 
 		 343 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  48.15 
 
 		 349 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  53.67 
 
 		 371 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  50.51 
 
 		 364 aa  207  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 349 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  48.53 
 
 		 343 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  54.82 
 
 		 368 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1531  ABC transporter related  45.59 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.952965  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  48.9 
 
 		 405 aa  207  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  47.47 
 
 		 349 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  47.47 
 
 		 349 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  47.47 
 
 		 349 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  50.91 
 
 		 342 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 		 350 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 387 aa  205  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  52.79 
 
 		 361 aa  205  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 352 aa  204  7e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  51.24 
 
 		 376 aa  204  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  49.5 
 
 		 357 aa  204  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  46.7 
 
 		 360 aa  204  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.55 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  47.55 
 
 		 343 aa  202  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  48.86 
 
 		 377 aa  203  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  54.92 
 
 		 355 aa  202  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  47.95 
 
 		 389 aa  201  7e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  54.13 
 
 		 360 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  54.13 
 
 		 360 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  47.91 
 
 		 355 aa  201  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  43.64 
 
 		 352 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0442  putative iron ABC transporter, ATP-binding protein  44.6 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  52.38 
 
 		 361 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  48.84 
 
 		 373 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  48.86 
 
 		 364 aa  198  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  50.73 
 
 		 348 aa  198  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 352 aa  197  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2071  ABC transporter related  48.62 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.75 
 
 		 352 aa  197  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.18 
 
 		 356 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.73 
 
 		 356 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>