More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_08641 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
352 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  89.68 
 
 
352 aa  634    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  86.93 
 
 
352 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07781  ABC transporter ATP-binding protein  75.85 
 
 
352 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  45.32 
 
 
352 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09571  ABC transporter ATP-binding protein  47.55 
 
 
356 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0852854  hitchhiker  0.000225107 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 
352 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  46.99 
 
 
352 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  45.4 
 
 
366 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0878  ATPase  45.91 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0670  ATPase  42.36 
 
 
356 aa  273  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.375513  normal  0.345411 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  38.81 
 
 
368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  42.64 
 
 
360 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  42.64 
 
 
360 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  39.3 
 
 
378 aa  260  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  39.04 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  40.8 
 
 
346 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  39.76 
 
 
363 aa  249  4e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  38.87 
 
 
342 aa  248  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
387 aa  246  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 
346 aa  245  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  35.59 
 
 
377 aa  241  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  38.58 
 
 
355 aa  239  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.88 
 
 
354 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  40.91 
 
 
369 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  39.41 
 
 
343 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  34.88 
 
 
363 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  38.53 
 
 
343 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  40.61 
 
 
369 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  39.23 
 
 
342 aa  237  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  44.64 
 
 
369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  38.54 
 
 
389 aa  235  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  53.46 
 
 
369 aa  235  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  36.55 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  43.6 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  44.64 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  43.45 
 
 
358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
343 aa  233  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  40 
 
 
342 aa  232  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 
343 aa  232  9e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  43.94 
 
 
368 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  43.19 
 
 
359 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  41.14 
 
 
357 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  47.28 
 
 
360 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  48.2 
 
 
369 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.49 
 
 
352 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.41 
 
 
355 aa  229  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  33.81 
 
 
365 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  36.44 
 
 
349 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  36.21 
 
 
349 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
349 aa  228  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 
378 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  42.12 
 
 
355 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  37.65 
 
 
372 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  43.6 
 
 
357 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  37.83 
 
 
342 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
353 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  37.42 
 
 
333 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  37.83 
 
 
342 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 
353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  36.44 
 
 
349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  39.67 
 
 
342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  40.26 
 
 
353 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  39.17 
 
 
353 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  44.58 
 
 
257 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  36.52 
 
 
349 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  39.4 
 
 
373 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  37.65 
 
 
367 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  35.58 
 
 
364 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  37.3 
 
 
366 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  44.18 
 
 
257 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  37.66 
 
 
364 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  44.18 
 
 
257 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
350 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  41.81 
 
 
353 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  37.46 
 
 
343 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  38.37 
 
 
336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 
353 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  35.15 
 
 
373 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.99 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  37.25 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.56 
 
 
359 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  35.09 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.41 
 
 
257 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  38.87 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  35.55 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  38.25 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  46.84 
 
 
257 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  40.68 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  38.08 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  48.05 
 
 
354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  34.63 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.15 
 
 
363 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  45.99 
 
 
257 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  45.99 
 
 
257 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  44.35 
 
 
344 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  39.22 
 
 
389 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>