More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_17671 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
352 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09571  ABC transporter ATP-binding protein  54.6 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0852854  hitchhiker  0.000225107 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0878  ATPase  62.22 
 
 
372 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  49.15 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  49.14 
 
 
352 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  46.49 
 
 
352 aa  355  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  45.61 
 
 
352 aa  349  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  45.32 
 
 
352 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0670  ATPase  55.84 
 
 
356 aa  344  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.375513  normal  0.345411 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07781  ABC transporter ATP-binding protein  44.74 
 
 
352 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  46.04 
 
 
378 aa  291  9e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  45.92 
 
 
366 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  45.24 
 
 
368 aa  280  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  44.22 
 
 
342 aa  262  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  53.85 
 
 
390 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  43.34 
 
 
363 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.9 
 
 
387 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  47.06 
 
 
360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  47.06 
 
 
360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.13 
 
 
352 aa  245  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  44.41 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  45.45 
 
 
346 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  39.62 
 
 
377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1829  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
354 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  39.68 
 
 
360 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  44.51 
 
 
365 aa  235  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  46.4 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  39.65 
 
 
358 aa  233  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  44.11 
 
 
369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  44.3 
 
 
342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  45.02 
 
 
369 aa  232  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  50 
 
 
357 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.86 
 
 
355 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  43.46 
 
 
365 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  44.23 
 
 
353 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  43.42 
 
 
348 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  38.87 
 
 
342 aa  228  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  42.68 
 
 
386 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.51 
 
 
353 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  40.68 
 
 
369 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  40.23 
 
 
369 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  49.36 
 
 
369 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  52.5 
 
 
257 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  43.47 
 
 
410 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 
353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  51.43 
 
 
257 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  42.63 
 
 
363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  52.24 
 
 
257 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  40.23 
 
 
369 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  49.18 
 
 
358 aa  226  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.18 
 
 
367 aa  225  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  41.27 
 
 
349 aa  225  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  42.72 
 
 
361 aa  225  9e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
353 aa  225  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  43.63 
 
 
370 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  38.72 
 
 
389 aa  225  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  43.71 
 
 
358 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  43.71 
 
 
358 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.54 
 
 
352 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  40.18 
 
 
369 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.12 
 
 
359 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 
341 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  52.08 
 
 
257 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  40.43 
 
 
359 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  39.87 
 
 
349 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  43.04 
 
 
368 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 
367 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  50.41 
 
 
257 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  52.24 
 
 
257 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  52.24 
 
 
257 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  43.56 
 
 
347 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  37.93 
 
 
342 aa  223  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  40.31 
 
 
353 aa  223  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  38.53 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  40.29 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.12 
 
 
347 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  42.05 
 
 
355 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.79 
 
 
343 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
354 aa  219  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  44.22 
 
 
357 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  46.1 
 
 
352 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  37.8 
 
 
362 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  39.93 
 
 
349 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  38.31 
 
 
342 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  43.33 
 
 
354 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  35.63 
 
 
343 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 
349 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  38.3 
 
 
349 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.97 
 
 
259 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  38.3 
 
 
349 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  40.92 
 
 
342 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  38.32 
 
 
349 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.72 
 
 
362 aa  217  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  39.41 
 
 
349 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  42.38 
 
 
356 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
375 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  42.62 
 
 
368 aa  217  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  39.93 
 
 
349 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 
353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  39.39 
 
 
361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>