More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1642 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1642  ABC-type sugar transport system, ATPase component  100 
 
 		 361 aa  732    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0252  ABC transporter related  55.62 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  41.27 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  39.52 
 
 		 370 aa  272  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 365 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0629  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.14 
 
 		 376 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  41.06 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6112  ABC transporter related  47.59 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  41.59 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  40.17 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  42.72 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  38.9 
 
 		 378 aa  266  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  39.35 
 
 		 383 aa  265  7e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 365 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 364 aa  264  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  39.89 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  38.8 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  39.06 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  40.23 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  37.6 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  39.94 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  40.27 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  37.6 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  37.6 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 364 aa  263  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  40.11 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  40 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  41.14 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  39.73 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  39.78 
 
 		 367 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  41.55 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  39.78 
 
 		 367 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  39.29 
 
 		 369 aa  259  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  38.98 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  38.63 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5388  ABC transporter related  39.04 
 
 		 352 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  41.49 
 
 		 382 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  38.58 
 
 		 386 aa  258  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  36.79 
 
 		 388 aa  258  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 		 399 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  43.96 
 
 		 348 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  39.34 
 
 		 375 aa  256  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  39.57 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  37.99 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  39.06 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2208  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 		 363 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  37.6 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  36.2 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  36.81 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  41.46 
 
 		 393 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  37.57 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  39.94 
 
 		 359 aa  252  8.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 387 aa  251  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 374 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  35.96 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  36.84 
 
 		 370 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  40.38 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  37.53 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  35.83 
 
 		 366 aa  250  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  36.69 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  40.06 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  38.78 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  39.55 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  38.78 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  42.95 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.26 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  38.04 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  39.77 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  40.11 
 
 		 365 aa  250  3e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  36.36 
 
 		 380 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 		 366 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 		 366 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  38.03 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  40.5 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  38.19 
 
 		 380 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 371 aa  249  6e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  37.53 
 
 		 409 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  37.67 
 
 		 380 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  39.31 
 
 		 389 aa  249  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 366 aa  248  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 		 366 aa  248  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  36.81 
 
 		 358 aa  248  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4487  ABC transporter related protein  37.57 
 
 		 380 aa  248  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  35.64 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>