More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0308 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  100 
 
 
360 aa  723    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  82.82 
 
 
356 aa  612  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  77.75 
 
 
356 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  53.15 
 
 
370 aa  361  1e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  56.61 
 
 
355 aa  323  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  56.27 
 
 
355 aa  322  8e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  48.58 
 
 
356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  47.32 
 
 
353 aa  299  4e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  47.79 
 
 
363 aa  288  9e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0657  ABC transporter related protein  44.92 
 
 
353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  46.73 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  47.13 
 
 
367 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  47.13 
 
 
367 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  48.04 
 
 
358 aa  281  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  47.18 
 
 
367 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  45.45 
 
 
366 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 
373 aa  278  9e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  41.6 
 
 
382 aa  277  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  48.34 
 
 
367 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  46.98 
 
 
353 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  43.51 
 
 
367 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  45.77 
 
 
371 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  42.82 
 
 
357 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
378 aa  276  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  44.03 
 
 
370 aa  276  4e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  43.56 
 
 
369 aa  275  7e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  48.8 
 
 
359 aa  275  7e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.66 
 
 
349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  44.6 
 
 
372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  40.16 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  42.46 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  47.73 
 
 
374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  43.52 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  41.37 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  47.83 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  45.96 
 
 
375 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  42.73 
 
 
363 aa  273  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  41.48 
 
 
366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  42.02 
 
 
370 aa  273  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  46.64 
 
 
405 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0811  ABC transporter related protein  46.18 
 
 
371 aa  271  9e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  42.25 
 
 
352 aa  271  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  51.98 
 
 
385 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 
369 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  46.23 
 
 
368 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  43.43 
 
 
370 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  45.54 
 
 
402 aa  271  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  46.58 
 
 
358 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  43.21 
 
 
358 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  40.5 
 
 
385 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  43.96 
 
 
366 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.98 
 
 
351 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.92 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  45.03 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  39.84 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.84 
 
 
366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2865  ABC transporter related  44.18 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  48.53 
 
 
426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  47.04 
 
 
365 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  51.98 
 
 
366 aa  269  4e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  51.98 
 
 
366 aa  269  4e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  41.33 
 
 
358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  42.3 
 
 
355 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  41.24 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  39.55 
 
 
356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.51 
 
 
376 aa  268  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1662  ABC transporter related  44.75 
 
 
347 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199589  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  44.44 
 
 
360 aa  269  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  48.37 
 
 
342 aa  268  8.999999999999999e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  46.18 
 
 
374 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  44.62 
 
 
384 aa  268  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.55 
 
 
351 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.97 
 
 
369 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  46.84 
 
 
375 aa  268  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  43.67 
 
 
352 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  44.11 
 
 
367 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  46.38 
 
 
370 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  43.5 
 
 
382 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2554  ABC transporter related  50.19 
 
 
369 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 
366 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 
366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  42.46 
 
 
398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  45.96 
 
 
364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  39.82 
 
 
366 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3069  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.85 
 
 
397 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  46.43 
 
 
368 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.81 
 
 
367 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.45 
 
 
349 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 
366 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 
366 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 
366 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 
366 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 
366 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
406 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  39.61 
 
 
353 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  42.23 
 
 
355 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.45 
 
 
349 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  40.87 
 
 
373 aa  265  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5875  ABC transporter related protein  46.2 
 
 
351 aa  265  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0109503  normal  0.629454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>