More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0252 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0252  ABC transporter related  100 
 
 		 356 aa  709    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1642  ABC-type sugar transport system, ATPase component  55.62 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0064  ABC transporter related  45.66 
 
 		 380 aa  290  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  40.53 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  40.53 
 
 		 405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  40.53 
 
 		 405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  41.69 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  40.64 
 
 		 380 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 		 391 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  44.21 
 
 		 393 aa  276  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  42.09 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  41.24 
 
 		 370 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  39.52 
 
 		 418 aa  272  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  44.55 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  39.67 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  41.87 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  41.34 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  42.22 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  39 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  39.01 
 
 		 373 aa  270  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.23 
 
 		 371 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  37.31 
 
 		 408 aa  269  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  42.02 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  41.39 
 
 		 365 aa  269  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 378 aa  269  7e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  39.2 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  40.78 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  41.24 
 
 		 365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  37.56 
 
 		 388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  41.9 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  41.97 
 
 		 376 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  42.9 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  40.34 
 
 		 370 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  39.89 
 
 		 365 aa  265  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  42.22 
 
 		 431 aa  265  8.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0629  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.96 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  38.48 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  44.31 
 
 		 371 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  40.62 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 		 386 aa  263  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.11 
 
 		 369 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  40.5 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.27 
 
 		 369 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4487  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  39.61 
 
 		 375 aa  263  4.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 		 376 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 		 376 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  38.32 
 
 		 399 aa  262  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  38.06 
 
 		 388 aa  262  6e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  41.11 
 
 		 365 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  36.01 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  40 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  39.13 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  39.94 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5388  ABC transporter related  40.17 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  45.64 
 
 		 421 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.5 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  40 
 
 		 354 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  39.72 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  45.06 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  40.88 
 
 		 374 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  40.11 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  38.61 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  40.5 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.59 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  37.96 
 
 		 409 aa  259  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 387 aa  258  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2134  ABC transporter related protein  39.94 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  39.33 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.16 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  39.61 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  41.16 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  40.56 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  41.16 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  40.51 
 
 		 357 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.6 
 
 		 436 aa  257  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  41.27 
 
 		 355 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  38.54 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  39.79 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 416 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  41.6 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  38.24 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.88 
 
 		 349 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  38.87 
 
 		 357 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  38.57 
 
 		 365 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  40.67 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.25 
 
 		 349 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  43.61 
 
 		 372 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  43.61 
 
 		 372 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3680  ABC transporter related  36.66 
 
 		 364 aa  256  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  43.61 
 
 		 372 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  38.92 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>