More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6545 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  91.74 
 
 
351 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  100 
 
 
351 aa  715    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  46.63 
 
 
356 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  48.33 
 
 
364 aa  319  6e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  45.51 
 
 
359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  45 
 
 
370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  44.1 
 
 
355 aa  309  4e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  43.26 
 
 
355 aa  306  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  44.73 
 
 
367 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  43.26 
 
 
363 aa  300  2e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  43.94 
 
 
360 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  42.42 
 
 
384 aa  296  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  42.54 
 
 
365 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  42.4 
 
 
352 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  44.44 
 
 
367 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  44.26 
 
 
365 aa  295  1e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
385 aa  293  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  43.38 
 
 
363 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  43.6 
 
 
365 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  41.14 
 
 
369 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  46.06 
 
 
349 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  43.98 
 
 
360 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  42.18 
 
 
368 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  43.39 
 
 
352 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  43.44 
 
 
365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  41.94 
 
 
356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  41.8 
 
 
395 aa  288  9e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  40.5 
 
 
381 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  43.34 
 
 
353 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  41.55 
 
 
384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2267  ABC transporter related  47 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274393  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  40.6 
 
 
395 aa  286  4e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  41.13 
 
 
402 aa  286  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  43.02 
 
 
355 aa  285  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
382 aa  285  9e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  42.22 
 
 
366 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  42.77 
 
 
349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.13 
 
 
351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  43.06 
 
 
352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  45.22 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 
371 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.05 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2287  ABC transporter related  48.12 
 
 
362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  42.44 
 
 
357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  55.33 
 
 
362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  41.78 
 
 
367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  41.39 
 
 
360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  43.64 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  41.71 
 
 
359 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  42.9 
 
 
361 aa  282  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  41.16 
 
 
362 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  43.8 
 
 
356 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  40.5 
 
 
366 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  43.3 
 
 
353 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  41.29 
 
 
360 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  42.44 
 
 
359 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
364 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  41.55 
 
 
357 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  42.49 
 
 
353 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7821  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 
363 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  41.3 
 
 
384 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  45.97 
 
 
358 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  45.75 
 
 
350 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1445  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 
367 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  42.82 
 
 
353 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  41.39 
 
 
362 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  41.53 
 
 
354 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  42.9 
 
 
356 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  44.3 
 
 
358 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  39.94 
 
 
352 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  41.13 
 
 
364 aa  280  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
380 aa  279  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.07 
 
 
349 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  42.9 
 
 
365 aa  279  4e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  42.98 
 
 
356 aa  279  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.1 
 
 
359 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  39.83 
 
 
367 aa  279  6e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  41.58 
 
 
376 aa  279  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  39.83 
 
 
367 aa  279  6e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  42.46 
 
 
379 aa  279  6e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  41.3 
 
 
384 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  47.1 
 
 
359 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  40.39 
 
 
371 aa  278  8e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  46.5 
 
 
370 aa  278  8e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  42.33 
 
 
366 aa  278  8e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  40.7 
 
 
349 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.79 
 
 
349 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.53 
 
 
369 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  43.18 
 
 
351 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  44.22 
 
 
386 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  50.57 
 
 
360 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  40.17 
 
 
357 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  43.02 
 
 
357 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  43.44 
 
 
364 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  42.13 
 
 
359 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.97 
 
 
363 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  42.59 
 
 
371 aa  277  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  44.89 
 
 
352 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.324815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>