More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0949 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 355 aa  713    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 355 aa  713    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  99.72 
 
 		 355 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  99.72 
 
 		 355 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  96.34 
 
 		 355 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 355 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  88.45 
 
 		 355 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  88.17 
 
 		 355 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  87.89 
 
 		 355 aa  634    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 355 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  87.61 
 
 		 355 aa  630  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  86.76 
 
 		 355 aa  631  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  87.85 
 
 		 355 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  87.85 
 
 		 355 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  87.29 
 
 		 355 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  86.44 
 
 		 355 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  62.92 
 
 		 356 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2869  ABC transporter related  62.5 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0665765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  62.5 
 
 		 361 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 		 358 aa  434  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  61.97 
 
 		 356 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  61.97 
 
 		 356 aa  434  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  61.97 
 
 		 356 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  57.88 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  49.04 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  43.82 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  44.71 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  44.41 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4534  ABC transporter related  40.97 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251009  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3161  hypothetical protein  45.38 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.73 
 
 		 362 aa  259  4e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  42.27 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.36 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  46.63 
 
 		 347 aa  258  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  44.14 
 
 		 342 aa  256  5e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.73 
 
 		 355 aa  256  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.56 
 
 		 355 aa  255  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  46.42 
 
 		 352 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.09 
 
 		 357 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  43.94 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  43.94 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  41.23 
 
 		 358 aa  250  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  44.76 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 350 aa  249  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.53 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.98 
 
 		 393 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.94 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  48.94 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.71 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.48 
 
 		 366 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  45.16 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 		 343 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  44.38 
 
 		 350 aa  245  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  43.59 
 
 		 347 aa  245  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  43.16 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.12 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.04 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.77 
 
 		 364 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.25 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2917  ABC transporter-like protein  44.38 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.52 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  46.13 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.8 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.75 
 
 		 369 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  40.69 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  41.39 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.6 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.69 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.88 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.79 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  44.23 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.34 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  42.37 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.79 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.36 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.44 
 
 		 402 aa  240  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.79 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  44.09 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  38.78 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  43.03 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  46 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  44.84 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.74 
 
 		 356 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.75 
 
 		 371 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6322  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 385 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0819115  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.44 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  44.01 
 
 		 336 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.44 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  42.81 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.62 
 
 		 372 aa  239  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  44.44 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  44.81 
 
 		 347 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>