More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4219 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  100 
 
 		 399 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  72.83 
 
 		 391 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  62.64 
 
 		 383 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  60.93 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  56.03 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  55.46 
 
 		 350 aa  378  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  54.6 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1610  ABC transporter related  56.82 
 
 		 359 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1591  ABC transporter related  56.82 
 
 		 359 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  56.45 
 
 		 352 aa  362  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  55.59 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1206  ABC transporter related  55.62 
 
 		 359 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1685  ABC transporter related  55.62 
 
 		 359 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5537  ABC transporter related  55.12 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1561  ABC transporter related  55.52 
 
 		 359 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4280  ABC transporter related  54.37 
 
 		 359 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4846  ABC transporter, ATPase subunit  55.65 
 
 		 359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  decreased coverage  0.000133931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  51.51 
 
 		 365 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  43.17 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  48.71 
 
 		 365 aa  295  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.53 
 
 		 381 aa  295  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  41.34 
 
 		 367 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  45.07 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  45.81 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  46.22 
 
 		 350 aa  292  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.6 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1655  ABC transporter related  46.13 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  45.92 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  46.24 
 
 		 362 aa  289  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 378 aa  289  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.82 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 376 aa  288  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.35 
 
 		 369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.07 
 
 		 365 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 		 355 aa  286  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 353 aa  285  8e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.22 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  42.7 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.93 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.38 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.35 
 
 		 395 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5131  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.71 
 
 		 381 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.67 
 
 		 365 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  49.02 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  49.49 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.37 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  48.69 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.28 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  48.04 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.69 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.79 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.04 
 
 		 374 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.71 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.04 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.79 
 
 		 362 aa  280  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.6 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.03 
 
 		 355 aa  280  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.07 
 
 		 349 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.52 
 
 		 373 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  50.85 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.45 
 
 		 355 aa  280  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  47.31 
 
 		 356 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  46.54 
 
 		 379 aa  279  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  42.94 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  54.96 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.34 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.31 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 		 343 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.02 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  46.41 
 
 		 356 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  39.72 
 
 		 372 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  45.15 
 
 		 375 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  40.83 
 
 		 355 aa  277  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.63 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  40.56 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  41.34 
 
 		 350 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  49.17 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.46 
 
 		 369 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  46.39 
 
 		 347 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.94 
 
 		 393 aa  276  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  45.76 
 
 		 352 aa  275  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  50.33 
 
 		 364 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.26 
 
 		 352 aa  275  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  44.48 
 
 		 359 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  44.7 
 
 		 355 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  44.57 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  41.69 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.61 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.32 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.61 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  49.32 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  43.27 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  42.11 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>