More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3107 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  100 
 
 
224 aa  447  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2172  ABC transporter, ATP-binding protein  55.4 
 
 
222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  44.74 
 
 
236 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 
236 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  43.86 
 
 
236 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  43.42 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  43.48 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 
237 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  42.34 
 
 
227 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
233 aa  167  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  42.15 
 
 
227 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 
238 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.7 
 
 
227 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  45.91 
 
 
235 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  45.26 
 
 
227 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  41.44 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  43.62 
 
 
247 aa  166  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  43.05 
 
 
239 aa  165  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  41.85 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  41.44 
 
 
224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  43.84 
 
 
233 aa  164  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  42.73 
 
 
236 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 
249 aa  164  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  41.23 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  40.47 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  40.99 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  40.18 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  43.33 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  44.04 
 
 
242 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  42.08 
 
 
227 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  43.64 
 
 
246 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  42.79 
 
 
219 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.7 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  42.34 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  42.22 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  39.73 
 
 
233 aa  161  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
233 aa  161  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  39.73 
 
 
233 aa  161  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  42.53 
 
 
293 aa  161  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
227 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 
227 aa  161  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.73 
 
 
233 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
233 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
233 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
233 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
233 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
233 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 
234 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
224 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  44.15 
 
 
225 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  42.36 
 
 
230 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.83 
 
 
232 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  41.74 
 
 
230 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  42.55 
 
 
249 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  42.55 
 
 
249 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
227 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  42.55 
 
 
249 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 
253 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  40.96 
 
 
246 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  41.18 
 
 
232 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 
233 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  41.63 
 
 
227 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  41.87 
 
 
249 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
227 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 
234 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
235 aa  158  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  46.35 
 
 
234 aa  158  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.74 
 
 
237 aa  158  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  39.65 
 
 
230 aa  158  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  40.91 
 
 
247 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  41.74 
 
 
235 aa  158  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  39.06 
 
 
242 aa  158  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.36 
 
 
242 aa  158  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.73 
 
 
228 aa  157  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  40.65 
 
 
237 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  40.96 
 
 
250 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  43.23 
 
 
232 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  39.72 
 
 
224 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  38.12 
 
 
225 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 
224 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40.37 
 
 
237 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  40.89 
 
 
232 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  43.24 
 
 
227 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  44.9 
 
 
228 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  45.78 
 
 
231 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  41.24 
 
 
231 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  44.22 
 
 
246 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  40.27 
 
 
227 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.72 
 
 
245 aa  156  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  41.23 
 
 
388 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  42.16 
 
 
229 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  43.11 
 
 
235 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  43.24 
 
 
227 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  43.08 
 
 
225 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>