More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1038 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 234 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  98.72 
 
 		 234 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  79.22 
 
 		 236 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  80.26 
 
 		 236 aa  355  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  78.79 
 
 		 236 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  81.58 
 
 		 235 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  82.55 
 
 		 215 aa  338  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  77.29 
 
 		 236 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  76.86 
 
 		 236 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  76.42 
 
 		 236 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  76.42 
 
 		 236 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  56.22 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  53.95 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  56.14 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.51 
 
 		 236 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  56.33 
 
 		 243 aa  234  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  55.31 
 
 		 229 aa  232  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  53.95 
 
 		 249 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3395  ABC transporter related  53.1 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.502723  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  56 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3431  ABC transporter related  54.13 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0705  ABC transporter related  53.68 
 
 		 232 aa  221  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.349974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 		 247 aa  197  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2158  ABC transporter related  52 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.605751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  51.94 
 
 		 284 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  41.88 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  42.18 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  39.17 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  33.04 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.64 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  39.01 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  39.01 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  42.93 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  41.26 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  39.69 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  38.84 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  40.62 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.12 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  38.97 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  39.61 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  41.92 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  44 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  38.05 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  35.71 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0276  ABC transporter related protein  37.84 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  40.72 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  41.67 
 
 		 277 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  40.72 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  39.23 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  39.42 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  40.58 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  34.22 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  40.1 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  39.37 
 
 		 242 aa  141  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  35.71 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  36.55 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  43 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  33.88 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0974  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  39.57 
 
 		 408 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.9 
 
 		 646 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  40.2 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  37.5 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  40.21 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  42.42 
 
 		 237 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  37.28 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  36.89 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  39.53 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.64 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  41.62 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  37.61 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  43.54 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  40.78 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  40.78 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  38.5 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  40.5 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  41.67 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  37.78 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2097  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1529  ABC transporter related  43.27 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  41.48 
 
 		 453 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.94 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  36.27 
 
 		 240 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.19 
 
 		 226 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  34.53 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  38.91 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  39.69 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.19 
 
 		 226 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  36.24 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>