More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_06640 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  100 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  81.48 
 
 		 236 aa  342  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  84.58 
 
 		 235 aa  338  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  81.48 
 
 		 236 aa  339  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  80.56 
 
 		 236 aa  338  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  80 
 
 		 236 aa  330  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  82.55 
 
 		 234 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  82.55 
 
 		 234 aa  324  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  78.14 
 
 		 236 aa  320  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  77.67 
 
 		 236 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  78.14 
 
 		 236 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  54.76 
 
 		 242 aa  234  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  57.89 
 
 		 238 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  55.66 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0705  ABC transporter related  60.29 
 
 		 232 aa  223  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.349974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  57.49 
 
 		 249 aa  223  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  56.28 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  59.22 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 229 aa  215  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3395  ABC transporter related  54.37 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.502723  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  58.65 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3431  ABC transporter related  54.95 
 
 		 237 aa  207  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  52.91 
 
 		 284 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2158  ABC transporter related  54.07 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.605751 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1813  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  42.38 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  40.39 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  39.9 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  42.92 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  40.72 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  40.51 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  41.84 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  40.09 
 
 		 252 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  42.05 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  42.05 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  44.55 
 
 		 233 aa  141  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  39.2 
 
 		 235 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  45 
 
 		 271 aa  139  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  42.7 
 
 		 245 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  38.69 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  41.58 
 
 		 259 aa  138  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  44.39 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  42.92 
 
 		 235 aa  137  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.71 
 
 		 228 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  40.39 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  43.94 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  37.76 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  38.61 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  31.31 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  35.82 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  41.62 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  39 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.21 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.21 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  35.5 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.21 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  38.12 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  41.5 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  41.2 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  43 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  43 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  43 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  41.09 
 
 		 305 aa  134  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  38.31 
 
 		 242 aa  134  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.21 
 
 		 228 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  40.59 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  36.92 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  35.03 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  41 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  38.58 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  37.89 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43.5 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  43.72 
 
 		 291 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  41.62 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  38.1 
 
 		 241 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  41.62 
 
 		 260 aa  132  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  41.12 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  39.09 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.5 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  38.5 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  38.83 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  41.62 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  36.14 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  38.46 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 246 aa  131  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>