More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0427 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  57.39 
 
 		 242 aa  268  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  57.71 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  56.77 
 
 		 242 aa  261  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  53.95 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  54.78 
 
 		 236 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  53.51 
 
 		 236 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  54.35 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  55.31 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  53.74 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  54.35 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  53.74 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  54.87 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  52.38 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  54.07 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  47.39 
 
 		 243 aa  212  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3395  ABC transporter related  44.2 
 
 		 239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.502723  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.88 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  46.02 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  46.19 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 		 247 aa  201  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0705  ABC transporter related  51.36 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.349974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3431  ABC transporter related  47.49 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  48.04 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2158  ABC transporter related  46.43 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.605751 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1813  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  41.26 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  46.56 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  39.29 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  46.56 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2172  ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  41.1 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  41.36 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  40 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6457  ABC transporter related  37.61 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  37.56 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  40.21 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  38.57 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  39.9 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.39 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  35.96 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  40.31 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  42.16 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  42.86 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  40.78 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0607  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.44 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  41.57 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  41.58 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.94 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  41.97 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  38.46 
 
 		 231 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1717  ABC transporter related  39.8 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  39.89 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  38.84 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  39.49 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  41.14 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  42.02 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  41.57 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  39.22 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  41.14 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  39.9 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  39.79 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  34.95 
 
 		 357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  38.76 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  41.01 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  40 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  41.01 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  39.06 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  41.9 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  41.01 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  40.93 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  39.06 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  36.28 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3904  ABC transporter related  36.11 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  40.41 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 		 238 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2328  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  38.54 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.46 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  36.65 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4159  ABC transporter related  40.84 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  38.27 
 
 		 305 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  38.95 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  39.07 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  39.59 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  40.56 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  39.36 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  37.37 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  38.42 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  40.2 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  37.44 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  41.44 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  38.66 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  42.93 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  41.48 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>