More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2172 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2172  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  55.4 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  44.51 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  45.6 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  38.67 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  39.33 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  39.72 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  44.74 
 
 		 227 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  41.88 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  41.21 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  39.11 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 		 237 aa  145  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  38.6 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  38.76 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  38.76 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  38.76 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  38.76 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  41.4 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  38.67 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  38.67 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  38.67 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  38.71 
 
 		 237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  37.39 
 
 		 242 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  41.36 
 
 		 228 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  36.52 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  43.65 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  38.64 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  36.46 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  38.25 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  40.84 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  38.18 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  35.94 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  43.56 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  38.18 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  38.26 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  42.93 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  40.84 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  41.36 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  35.39 
 
 		 246 aa  141  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  40.28 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  40.28 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  40.21 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40.1 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  38.67 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  43.48 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  43.48 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  36.4 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3433  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  40.93 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  37.02 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  37.21 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  39.32 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  35.51 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  38.34 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  41.75 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  35.94 
 
 		 228 aa  138  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  40.98 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  39.49 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 230 aa  138  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  42.71 
 
 		 227 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  38.34 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  42.86 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 238 aa  138  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  39.79 
 
 		 288 aa  138  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  41.2 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  37.27 
 
 		 236 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1862  ABC transporter related  41.67 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203223 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  38.34 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  40.28 
 
 		 252 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  43.41 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.45 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 		 240 aa  138  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  43.41 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  39.63 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  40.51 
 
 		 280 aa  137  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  38.18 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  42.78 
 
 		 234 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  38.32 
 
 		 230 aa  137  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0707  ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0186  ABC transporter related  42.08 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.475038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  42.86 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  42.7 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  36.7 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  39.07 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>