More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2131 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  62.82 
 
 		 242 aa  311  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  65.22 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  57.71 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  58.08 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  57.71 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  58.15 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  56.09 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  56.71 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3395  ABC transporter related  51.75 
 
 		 239 aa  239  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.502723  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  57.27 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  54.82 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  54.55 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  54.55 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  53.51 
 
 		 249 aa  234  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  54.15 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  57.89 
 
 		 215 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.19 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0705  ABC transporter related  53.57 
 
 		 232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.349974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3431  ABC transporter related  50.66 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  49.15 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  47.32 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  48.89 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2158  ABC transporter related  47.56 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.605751 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1813  ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  40.09 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  39.05 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  43 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0607  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.01 
 
 		 237 aa  151  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  39.09 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  43.98 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  40.19 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  40.62 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  39.19 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  38.6 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  38.67 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  38.22 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  41 
 
 		 408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  40.21 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3904  ABC transporter related  40.64 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  40.72 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6457  ABC transporter related  38.89 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  41.03 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  41.63 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  41.21 
 
 		 238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  38.76 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  39.07 
 
 		 233 aa  144  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  38.21 
 
 		 271 aa  144  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  38.53 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  38.16 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  42.71 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  37.9 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  39.72 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  40.17 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  44.27 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  38.28 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  44.5 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  44.5 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  40.18 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  38.86 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  41.54 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  41.04 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  37.44 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0428  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  38.74 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00313991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  37.79 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  38.16 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 231 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 246 aa  141  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2172  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  42.7 
 
 		 252 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  41.75 
 
 		 445 aa  141  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  37.56 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  39.49 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4228  ABC transporter related  36.99 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0274229 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1484  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  39.8 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  38.28 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  38.31 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  39.8 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  40.82 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  39.8 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  41.54 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  42.93 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  38.07 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  39.09 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>