More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1966 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  100 
 
 		 233 aa  470  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.39 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  48.5 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.6 
 
 		 227 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  43.4 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  44.98 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  43.96 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  47.18 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  44.71 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  43.63 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  44.17 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  47.03 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  47.14 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  46.53 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.39 
 
 		 266 aa  165  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  41.74 
 
 		 233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  47.76 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  46.77 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  44.23 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  43.84 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  45.13 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3158  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.722977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.56 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3304  translation initiation factor IF-2  44.71 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  46.11 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.39 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  40.26 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  46.27 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 643 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  42.99 
 
 		 251 aa  162  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  47.15 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  42.79 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  46.7 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  42.79 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  39.52 
 
 		 293 aa  161  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.93 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  46.32 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  46.32 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  41.83 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  42.72 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  43.14 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  44.5 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  43.32 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  46.04 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  43.69 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  43.24 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  42.33 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  42.33 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  48.15 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  40.09 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  44.55 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  37.85 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  41.35 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  43.39 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  47.92 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  45.64 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  41.51 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  42.99 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  46.91 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  45.75 
 
 		 243 aa  158  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  45.05 
 
 		 242 aa  158  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  43.2 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  43.2 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  42.58 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  43.4 
 
 		 227 aa  157  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  40.19 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  45.21 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  39.81 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.59 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  41.26 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.36 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  41.18 
 
 		 271 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  45.36 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  40.39 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.05 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  42.52 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.03 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  43.88 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  42.33 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  43.93 
 
 		 239 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  43.13 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  43.75 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  42.54 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  39.91 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  41.09 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>