More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3158 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_3158  ABC transporter related protein  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.722977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3304  translation initiation factor IF-2  99.53 
 
 		 221 aa  422  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  43.55 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  46.28 
 
 		 253 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 249 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  47.89 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  45.74 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  45.74 
 
 		 249 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  45.74 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  43.07 
 
 		 249 aa  168  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  44.55 
 
 		 251 aa  168  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  51.58 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  51.04 
 
 		 236 aa  167  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  46.28 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  46.28 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  46.28 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  43.46 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  46.28 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  48.95 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  50.26 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  43.56 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  48.15 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  44.74 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  47 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  43.46 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  47.5 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1467  ABC transporter related  46.32 
 
 		 232 aa  164  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  42.79 
 
 		 246 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  42.47 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  42.21 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  44.62 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.31 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.31 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.43 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 236 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  47.37 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.2 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  47.89 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  42.08 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  45.45 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  47.89 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  45.5 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.39 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  46.07 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  50.54 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  42.63 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  41.71 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  45.26 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  48.68 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.07 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  45.6 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  45.79 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1427  ABC transporter related  44.32 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  48.68 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  45.79 
 
 		 237 aa  158  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  46.81 
 
 		 239 aa  158  5e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2200  ABC transporter-related protein  43.92 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.74 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  48.68 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  42.05 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  42.16 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  47.37 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43 
 
 		 230 aa  157  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.94 
 
 		 228 aa  157  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.92 
 
 		 234 aa  157  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43 
 
 		 253 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.92 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  48.15 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.32 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  41.67 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.92 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  42.86 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2328  ABC transporter related protein  45.2 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705701  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.93 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  42.86 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  46 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  40.22 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  49.2 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 238 aa  155  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 233 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  47.09 
 
 		 234 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>