More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3030 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  86.87 
 
 		 238 aa  353  8.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  85.86 
 
 		 242 aa  339  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  85.86 
 
 		 250 aa  338  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  83.84 
 
 		 237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  82.91 
 
 		 228 aa  333  7e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  81.73 
 
 		 240 aa  329  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  79.7 
 
 		 236 aa  324  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  79 
 
 		 224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  79.29 
 
 		 237 aa  319  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  75.13 
 
 		 233 aa  297  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1385  ABC transporter related  69.7 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00534091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  66 
 
 		 234 aa  260  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  62.12 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1880  ABC transporter-related protein  72.83 
 
 		 195 aa  252  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  63.68 
 
 		 228 aa  250  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  65.13 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  65.13 
 
 		 228 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  62.31 
 
 		 227 aa  248  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  62.63 
 
 		 227 aa  247  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  63.96 
 
 		 227 aa  247  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  62.5 
 
 		 228 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1529  ABC transporter related  65.67 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  64.1 
 
 		 227 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1862  ABC transporter related  66.67 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  64.97 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1718  ABC transporter ATP-binding protein  65.67 
 
 		 236 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  64.5 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  65.66 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1918  ABC transporter related  65.66 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  65.99 
 
 		 238 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  65.99 
 
 		 238 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  65.99 
 
 		 238 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  65.99 
 
 		 238 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  57.87 
 
 		 228 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  65.99 
 
 		 238 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  65.99 
 
 		 238 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  61.81 
 
 		 228 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1941  ABC transporter related  65.15 
 
 		 224 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  65.33 
 
 		 237 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1836  ABC transporter related  65.66 
 
 		 233 aa  237  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175217 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  64.97 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  65.66 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  57.29 
 
 		 237 aa  235  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  62.94 
 
 		 224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  57.36 
 
 		 226 aa  232  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  60.61 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  56.35 
 
 		 249 aa  231  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  56.35 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  59.79 
 
 		 219 aa  231  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  56.35 
 
 		 249 aa  230  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  55.28 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  55.84 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  55.84 
 
 		 251 aa  228  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  61.03 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  62.12 
 
 		 226 aa  228  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  56.35 
 
 		 242 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  56.57 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  56.35 
 
 		 242 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  56.35 
 
 		 242 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  56.35 
 
 		 246 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  61.62 
 
 		 227 aa  227  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  62.12 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  54.82 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  60.75 
 
 		 239 aa  224  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  55.67 
 
 		 247 aa  223  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  60.1 
 
 		 227 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  56 
 
 		 239 aa  223  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  60.1 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  55.5 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  54.82 
 
 		 246 aa  222  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  53.06 
 
 		 232 aa  221  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  58.67 
 
 		 235 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  55 
 
 		 249 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  55.15 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  57.58 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  54.31 
 
 		 249 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  53.27 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  56.77 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  53.27 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  53 
 
 		 250 aa  215  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  55.78 
 
 		 235 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.04 
 
 		 228 aa  213  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  60.64 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  59.24 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0650  ABC transporter related  61.22 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.861483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  53.3 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.05 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  55.61 
 
 		 243 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  55.33 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  54.31 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  50.25 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  53.77 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  52.28 
 
 		 242 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2115  ABC transporter related  60.2 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  53.3 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  53.81 
 
 		 235 aa  208  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  55.33 
 
 		 237 aa  208  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>