More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1880 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1880  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 195 aa  383  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1385  ABC transporter related  92.67 
 
 		 232 aa  332  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00534091  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1529  ABC transporter related  81.87 
 
 		 236 aa  287  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1862  ABC transporter related  82.72 
 
 		 236 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1718  ABC transporter ATP-binding protein  81.68 
 
 		 236 aa  278  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  73.02 
 
 		 236 aa  275  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  74.33 
 
 		 242 aa  273  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  74.33 
 
 		 250 aa  273  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  71.58 
 
 		 228 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  74.59 
 
 		 233 aa  269  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  72.83 
 
 		 200 aa  266  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  72.58 
 
 		 224 aa  263  8.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  70.74 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  71.35 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  71.2 
 
 		 238 aa  262  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  70.05 
 
 		 237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  70.81 
 
 		 227 aa  254  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  70.27 
 
 		 227 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  68.82 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  71.28 
 
 		 228 aa  251  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  72.73 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  72.73 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  72.73 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  72.73 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  72.73 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  72.73 
 
 		 238 aa  248  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  70.59 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  68.62 
 
 		 233 aa  247  9e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  68.98 
 
 		 228 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1941  ABC transporter related  70.37 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  71.66 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  67.91 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  71.12 
 
 		 238 aa  245  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  68.45 
 
 		 227 aa  245  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  68.45 
 
 		 228 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  65.41 
 
 		 228 aa  244  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  69.84 
 
 		 237 aa  244  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1918  ABC transporter related  69.84 
 
 		 224 aa  244  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1836  ABC transporter related  69.11 
 
 		 233 aa  243  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  69.63 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  70.59 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  68.98 
 
 		 228 aa  242  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  69.84 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  67.03 
 
 		 219 aa  237  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  61.29 
 
 		 226 aa  236  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  61.62 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  64.32 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  63.78 
 
 		 228 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  68.98 
 
 		 227 aa  234  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  70.49 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  68.78 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  63.35 
 
 		 237 aa  230  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  67.91 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  57.81 
 
 		 246 aa  228  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  65.95 
 
 		 224 aa  227  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  58.64 
 
 		 228 aa  226  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  60.11 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  58.92 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  60.22 
 
 		 241 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  59.46 
 
 		 237 aa  223  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  69.73 
 
 		 227 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  61.38 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  57.84 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  61.9 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  63.1 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  62.96 
 
 		 228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  63.24 
 
 		 239 aa  221  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  61.38 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  56.91 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  56.91 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  58.2 
 
 		 250 aa  220  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  56.91 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  56.61 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  57.14 
 
 		 251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  58.6 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  59.46 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  56.77 
 
 		 249 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  60.85 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  56.91 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  64.13 
 
 		 235 aa  217  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  56.91 
 
 		 242 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  56.91 
 
 		 242 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  56.91 
 
 		 242 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  55.9 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  59.26 
 
 		 228 aa  214  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  59.26 
 
 		 228 aa  214  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.26 
 
 		 228 aa  214  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  59.26 
 
 		 228 aa  214  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.26 
 
 		 228 aa  214  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.26 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.26 
 
 		 228 aa  214  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.26 
 
 		 228 aa  214  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.26 
 
 		 228 aa  214  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  58.73 
 
 		 228 aa  214  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  58.73 
 
 		 228 aa  214  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  60.77 
 
 		 224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  66.67 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  58.73 
 
 		 228 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>