More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0682 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  95.76 
 
 		 236 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  84.32 
 
 		 236 aa  407  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  82.25 
 
 		 236 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  81.28 
 
 		 236 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  81.39 
 
 		 236 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  80.95 
 
 		 236 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  78.26 
 
 		 235 aa  348  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  78.79 
 
 		 234 aa  342  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  78.95 
 
 		 234 aa  341  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  80.56 
 
 		 215 aa  338  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  55.84 
 
 		 242 aa  241  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  53.71 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  54.15 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.33 
 
 		 236 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  54.08 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3395  ABC transporter related  51.74 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.502723  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  55 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  52.05 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0705  ABC transporter related  53.42 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.349974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  53.95 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3431  ABC transporter related  50.68 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2158  ABC transporter related  53.1 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.605751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  51.15 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  44.21 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1813  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  43.41 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  42.25 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  41.5 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  42.56 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  42.15 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  40.58 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  37.61 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  38.39 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  38.39 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2172  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 		 222 aa  144  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1718  ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  40.1 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  40.1 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  40.45 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  37.89 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.95 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  42 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  37.33 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  37.55 
 
 		 644 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.44 
 
 		 242 aa  138  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  40.1 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 		 250 aa  138  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1862  ABC transporter related  43.96 
 
 		 236 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1529  ABC transporter related  43.96 
 
 		 236 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  41.09 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  36.89 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  41.41 
 
 		 653 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  42.05 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  39.11 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  38.79 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  41.5 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  39.91 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  40.61 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  36.41 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  38.32 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  38.67 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  36.5 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  35.53 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  37.17 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  37.33 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  36.68 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  42.11 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  41.43 
 
 		 233 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  38.19 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  39.71 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  40.69 
 
 		 408 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  37.96 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  37.37 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  40.3 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  41.41 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  35.5 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  36.79 
 
 		 248 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  37.33 
 
 		 242 aa  135  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 221 aa  135  8e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1200  ABC transporter related  39.04 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31235  normal  0.0871936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.52 
 
 		 646 aa  134  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  36 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  37.67 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  34.5 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  35.27 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  37.88 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  39.32 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  38.43 
 
 		 654 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  34.93 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>