More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3864 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  80.51 
 
 		 236 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  80.93 
 
 		 236 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  80.51 
 
 		 236 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  79.66 
 
 		 236 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  80.08 
 
 		 236 aa  361  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  80 
 
 		 236 aa  360  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  78.26 
 
 		 236 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  84.58 
 
 		 215 aa  347  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  81.58 
 
 		 234 aa  345  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  81.58 
 
 		 234 aa  344  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  58.08 
 
 		 238 aa  254  9e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  54.43 
 
 		 242 aa  248  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  53.19 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3395  ABC transporter related  55.8 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.502723  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  57.99 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  58.37 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.77 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  57.71 
 
 		 241 aa  228  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 229 aa  228  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0705  ABC transporter related  55.65 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.349974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3431  ABC transporter related  52.75 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2158  ABC transporter related  52.89 
 
 		 226 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.605751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  52.43 
 
 		 284 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  47.32 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 254 aa  187  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  43.11 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1813  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  42.01 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  39.21 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  38.05 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  39.29 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1291  ABC transporter component  43.69 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0276  ABC transporter related protein  37.78 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  38.67 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.06 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  40.28 
 
 		 252 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  36.73 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43.56 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43.56 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43.56 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  35.96 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  44.44 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  42.36 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  41.83 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  44.05 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43.56 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  39.91 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  42.08 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  41 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  36.73 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.08 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  41.67 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  38.7 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.08 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.08 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.08 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  40.5 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  42.08 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.08 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.08 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  39.72 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  38.01 
 
 		 225 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  38.01 
 
 		 225 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  43.35 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  36.12 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  38.99 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  37.17 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  43.94 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  38.03 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  36.87 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  41.38 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  35.86 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  44.23 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3459  ABC transporter related protein  38.39 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  37.5 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  40.2 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  43.46 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  38.05 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 		 250 aa  135  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  38.39 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  38.26 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  38.6 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  39.32 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  39.32 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3904  ABC transporter related  36.53 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.233959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>