More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0127 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4324  ABC transporter-related protein  79.75 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1409  ABC transporter related  68.91 
 
 		 242 aa  319  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.773805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  55.07 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  47.42 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  48.51 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  46.73 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  46.45 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.7 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.7 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  42.11 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  45 
 
 		 315 aa  191  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  45.29 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  45.22 
 
 		 241 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  39.92 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  43.97 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 246 aa  185  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  40.81 
 
 		 224 aa  185  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  46.85 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  41.47 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  42.08 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  41.59 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  41.59 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 224 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  43.26 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  39.04 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  42.17 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  40.91 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  43.38 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0312  ABC transporter related  40.85 
 
 		 242 aa  182  7e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.403569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  46.19 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  38.39 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  41.23 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  43.18 
 
 		 648 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.18 
 
 		 648 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  40.37 
 
 		 224 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  42.73 
 
 		 648 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  40.83 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.73 
 
 		 648 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.73 
 
 		 648 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  44.39 
 
 		 246 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.73 
 
 		 648 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  44 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  42.73 
 
 		 648 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  39.46 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.73 
 
 		 648 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  42.15 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  41.36 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  40.37 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  41.89 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  40.81 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.63 
 
 		 646 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  43.16 
 
 		 658 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  42.59 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 328 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  41.2 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  43.36 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  40.37 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  45.92 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  39.45 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  42.2 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  42.11 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4424  ABC transporter related  43.38 
 
 		 232 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.056527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4557  ABC transporter related  43.38 
 
 		 232 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0557853 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 226 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  45.95 
 
 		 228 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  42.23 
 
 		 225 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  40.25 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>