More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4324 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4324  ABC transporter-related protein  100 
 
 
248 aa  494  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  79.75 
 
 
252 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1409  ABC transporter related  73.28 
 
 
242 aa  328  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.773805  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  54.35 
 
 
249 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  46.84 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  46.01 
 
 
217 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  43.57 
 
 
252 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  45.29 
 
 
259 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.5 
 
 
230 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  44.34 
 
 
245 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  42.11 
 
 
237 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  43.44 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  41.01 
 
 
242 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 
226 aa  187  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43.89 
 
 
225 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  42.54 
 
 
277 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  41.82 
 
 
231 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43.89 
 
 
225 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  45.29 
 
 
644 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  40.27 
 
 
246 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  40.71 
 
 
229 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  41.94 
 
 
231 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  45 
 
 
315 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  45.45 
 
 
246 aa  185  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  46.02 
 
 
253 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  39.63 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  41.74 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  42.48 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  45.54 
 
 
241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
226 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  44.05 
 
 
241 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  41.96 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  39.15 
 
 
696 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  45.58 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  41.96 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  43.22 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
226 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 
226 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
226 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
226 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 
226 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
226 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 
248 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 
240 aa  181  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  43.98 
 
 
238 aa  181  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
222 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
229 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
226 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
225 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  40.93 
 
 
241 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 
226 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  40.27 
 
 
241 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  41.82 
 
 
234 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 
226 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  45.65 
 
 
244 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  42.86 
 
 
233 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  45.65 
 
 
244 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  42.01 
 
 
226 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  41.2 
 
 
328 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.86 
 
 
648 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  44.09 
 
 
242 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  43.16 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  41.78 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.18 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  43.89 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  45.5 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  42.61 
 
 
648 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  44.55 
 
 
235 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  45.78 
 
 
235 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 
235 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 
221 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0312  ABC transporter related  40.43 
 
 
242 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.403569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  44.64 
 
 
231 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  41.41 
 
 
235 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  44.44 
 
 
221 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.22 
 
 
665 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.73 
 
 
648 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  43.58 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.17 
 
 
648 aa  178  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.17 
 
 
648 aa  178  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  39.22 
 
 
665 aa  178  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  42.4 
 
 
244 aa  178  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  46.22 
 
 
245 aa  178  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  40.85 
 
 
231 aa  178  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  40.99 
 
 
235 aa  178  7e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406325  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  42.17 
 
 
648 aa  178  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  42.22 
 
 
264 aa  178  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  42.17 
 
 
648 aa  178  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.17 
 
 
648 aa  178  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  42.92 
 
 
237 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.17 
 
 
648 aa  178  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  40.37 
 
 
220 aa  178  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  40.37 
 
 
224 aa  178  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  42.31 
 
 
241 aa  178  9e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
238 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  41.06 
 
 
251 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  43.3 
 
 
232 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>