More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1294 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  74.34 
 
 		 231 aa  362  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  71.74 
 
 		 232 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  70.26 
 
 		 232 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  71.74 
 
 		 234 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  71.74 
 
 		 234 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  71.3 
 
 		 234 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  71.3 
 
 		 234 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  70.26 
 
 		 232 aa  349  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  71.3 
 
 		 232 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  71.3 
 
 		 232 aa  349  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  66.38 
 
 		 232 aa  338  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4424  ABC transporter related  68.53 
 
 		 232 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.056527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4557  ABC transporter related  68.53 
 
 		 232 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0557853 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  69.87 
 
 		 230 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  65.95 
 
 		 232 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  69.87 
 
 		 230 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  59.09 
 
 		 235 aa  281  8.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0312  ABC transporter related  54.24 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.403569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  46.72 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  44.39 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  43.42 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  43.72 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  42.79 
 
 		 241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  43.69 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  43.95 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  43.12 
 
 		 240 aa  191  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  42.6 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.6 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  45.7 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  43.23 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  43.18 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  44.19 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  41.89 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  43.95 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  40.91 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  42.98 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43.2 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43.2 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  41.15 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  42.98 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  43.95 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 		 248 aa  181  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  43.95 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  43.56 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  41.33 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  43.19 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  40.43 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  43 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 319 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  46.34 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  41.1 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  39.27 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  39.11 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  44.02 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  43.38 
 
 		 237 aa  178  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  40.64 
 
 		 225 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  44.09 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  46.02 
 
 		 239 aa  178  8e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 223 aa  178  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  41.59 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  44.09 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 		 214 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  39.62 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  43.3 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  39.45 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  41.1 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  39.37 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  40 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  39.73 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  38.57 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  38.74 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  43.96 
 
 		 241 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  37.61 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  38.26 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  41.63 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  41.94 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  42.73 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  39.37 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  44.89 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  40.09 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  36.77 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>