More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03781 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 254 aa  522  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  54.62 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 238 aa  215  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1813  ABC transporter, ATP-binding protein  54.71 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  45.37 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.86 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  45.26 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  46.09 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  46.88 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  46.43 
 
 		 236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  45.37 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  45.06 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.3 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  46.38 
 
 		 215 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 		 234 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  39 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3431  ABC transporter related  44.09 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3395  ABC transporter related  41.94 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.502723  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0705  ABC transporter related  46.05 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.349974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  42.04 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  42.15 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  36.77 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  38.68 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  41.26 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.9 
 
 		 238 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  42.16 
 
 		 264 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6457  ABC transporter related  37.61 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  38.79 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  39.58 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0758  ABC transporter related  39.02 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0209945  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1084  ABC transporter related  38.43 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1795  ABC transporter related protein  41.4 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  36.94 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  42.54 
 
 		 254 aa  141  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  42.02 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  37.67 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  37.67 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  40.7 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  39.09 
 
 		 233 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  39.52 
 
 		 237 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  39.52 
 
 		 237 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  43.5 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  40.91 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  40.95 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2158  ABC transporter related  40.91 
 
 		 226 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.605751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  37 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  37.33 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  36.68 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  37.04 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  38.57 
 
 		 236 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4587  cell division ATP-binding protein FtsE  42 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.94 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  38.12 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  38.12 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5124  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  41 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  38.1 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  37.62 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  37.67 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  38.12 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  34.22 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 228 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  39.73 
 
 		 233 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  35.81 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  38.34 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  41.75 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  41.75 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  41.75 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  41.75 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  36.07 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.21 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2804  ABC transporter related protein  35.55 
 
 		 366 aa  135  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  40.82 
 
 		 408 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 224 aa  135  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  36.24 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  38.53 
 
 		 715 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  40.49 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  40 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  37.04 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000106993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  36.36 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  38.27 
 
 		 950 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2492  ABC transporter related protein  43.01 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  40.84 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3478  ABC transporter related  39.24 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.07 
 
 		 648 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.16 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  38.89 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>