More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2158 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2158  ABC transporter related  100 
 
 		 226 aa  440  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.605751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4470  ABC transporter  52.42 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.991602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0560  ABC transporter related  53.1 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206066  normal  0.575191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0682  ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5026  ABC transporter-like  52.21 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0542  ABC transporter related  52.65 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0552  ABC transporter related  53.54 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0507  efflux ABC transporter ATP-binding protein  52.65 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.843726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06640  ABC transporter, ATP-binding component  53.81 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0705  ABC transporter related  52.05 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.349974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3864  ABC transporter related  52.89 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1038  ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11310  ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00773  hypothetical protein  45.61 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001700  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.96 
 
 		 242 aa  198  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3395  ABC transporter related  53.62 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.502723  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0427  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.9166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1564  ABC transporter related  48.88 
 
 		 249 aa  187  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3494  ABC transporter related  53.08 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1826  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.22 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3558  ABC transporter-related protein  47.79 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0306  ABC transporter related  43.86 
 
 		 284 aa  168  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3431  ABC transporter related  46.23 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03781  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  41.85 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1966  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0254088  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  35.75 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  43.08 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  42.86 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  38.36 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  39.49 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  37.31 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  39.9 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  39.9 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  39.9 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  39.9 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4112  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  37.5 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  35 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  39.29 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  37.5 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  38.35 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3918  ABC transporter related  36.02 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  37.5 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  41 
 
 		 222 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  41.23 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2355  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 255 aa  124  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2972  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 255 aa  124  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.344281 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.74 
 
 		 242 aa  124  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  39.6 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2146  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.278232  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  37.8 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  40.78 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2172  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  38.61 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  39.51 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2162  ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 255 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.754182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  38.61 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  35.44 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  39.8 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2420  ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.658909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  39.25 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2490  ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.755313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  37.5 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  40.11 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  39.81 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1315  ABC transporter-related protein  35.98 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.26423  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  37 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  37.74 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0974  ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  35.82 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  39.7 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  34.27 
 
 		 234 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  35.75 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  39.11 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  37.98 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2843  ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  42.44 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  35.26 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2406  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  39.78 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4985  ABC transporter, ATP-binding protein  37.36 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  40.62 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4857  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4565  ABC transporter, ATP-binding protein  37.36 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4956  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  37.36 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  39.5 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01332  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  36.45 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5201  bacitracin export ATP-binding protein BceA  39.23 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4972  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  37.36 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>