More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01332 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01332  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  45.45 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  43.26 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  43.26 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  43.26 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  43.26 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  42.59 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  42.99 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  43.19 
 
 		 223 aa  167  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  45.07 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  43.75 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  44.23 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  41.82 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  43.75 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  44.7 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  41.47 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  41.26 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0080  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0066194  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  42.99 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  41.26 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  42.47 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  41.78 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1577  ABC transporter related  39.65 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.039457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  42.29 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  41.78 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  42.53 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  40.27 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.4 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  39.27 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  42.44 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  38.89 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  44.29 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  42.44 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  41.4 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  40.37 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  43.05 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 247 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  42.44 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  40.93 
 
 		 251 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  41.26 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  41.29 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  41.67 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  43.87 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  40.95 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  40.83 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  41.95 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  42.34 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  41.78 
 
 		 246 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2085  ABC transporter related  45.27 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  41.5 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  40.87 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  40.83 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  40.83 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  39.73 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1467  ABC transporter related  39.73 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  41.07 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  41.46 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  42.25 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  42.29 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  41.46 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  41.79 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  43.56 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  37.22 
 
 		 240 aa  155  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  39.29 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  41.83 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  40.74 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  41.85 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  41 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.07 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  40.29 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  41.7 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  42.86 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  40.38 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  42.42 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>