More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003770 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  95.52 
 
 		 223 aa  440  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  87 
 
 		 227 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  79.37 
 
 		 223 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  48.4 
 
 		 217 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  47.71 
 
 		 255 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  48.66 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  46.54 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  47.25 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  47.25 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  47.25 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  47.25 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  47.71 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  47.47 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  46.79 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  47.39 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  47.39 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  47.39 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  46.05 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  46.08 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  45.87 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  45.16 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  48.39 
 
 		 217 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  44.29 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  44.98 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  46.76 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  43.69 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  44.7 
 
 		 221 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  45.37 
 
 		 221 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  45.7 
 
 		 243 aa  171  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  46.3 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  45.62 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.97 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  40.99 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  44.04 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  41.1 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  45.45 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  42.01 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.95 
 
 		 664 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  41.18 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  42.47 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  41.01 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  42.44 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  40.81 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  45.45 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  43.19 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  40.18 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  43.89 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 242 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  44.7 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  42.27 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.83 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  36.41 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 232 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  39.17 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  40.64 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  40.18 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  44.24 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  42.79 
 
 		 455 aa  158  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  40 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  42.27 
 
 		 258 aa  158  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 643 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  41.55 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  40.55 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  38.71 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5546  ABC transporter related  42.08 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  hitchhiker  0.00000572537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  39.01 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  39.17 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  46.33 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  37.73 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  43.72 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0523  ABC transporter related  40.27 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  40.95 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  36.41 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.55 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  41.55 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  39.46 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  38.07 
 
 		 604 aa  155  7e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  40.91 
 
 		 246 aa  154  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  40.28 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2646  ABC transporter related  41.36 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1417  ABC transporter related  42.15 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.275967  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2702  ABC transporter related  41.36 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  39.63 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  38.64 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1272  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.1 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  41.82 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>