More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2171 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  100 
 
 		 221 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  94.12 
 
 		 221 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  93.67 
 
 		 221 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  81.11 
 
 		 218 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  68.22 
 
 		 217 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  63.93 
 
 		 222 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  64.95 
 
 		 222 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  62.04 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.41 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  60.65 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  63.43 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  62.96 
 
 		 226 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  55.56 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  57.87 
 
 		 217 aa  234  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  58.88 
 
 		 236 aa  234  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  60.65 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  56.02 
 
 		 227 aa  231  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  57.6 
 
 		 218 aa  231  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  59.72 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  58.8 
 
 		 217 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  57.48 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  53.43 
 
 		 220 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  46.48 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  49.24 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  49.24 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  49.24 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  48.08 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  48.33 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  47.85 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  45.71 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  45.07 
 
 		 224 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  46.51 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.08 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  43.98 
 
 		 291 aa  174  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  45.87 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  46.97 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 		 250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  47.6 
 
 		 258 aa  171  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.3 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  47 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  46.76 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  41.59 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  39.37 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  39.65 
 
 		 662 aa  169  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  48.77 
 
 		 243 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  44.5 
 
 		 245 aa  167  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  42.01 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  40.65 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  49.01 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  39.27 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  42.13 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  45.87 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  40.55 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  42.01 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  42.52 
 
 		 279 aa  165  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01332  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  41.47 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  41 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  44.19 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  43.05 
 
 		 232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 		 345 aa  164  8e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  44.19 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  43.64 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  41.94 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  41.63 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  38.99 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  39.72 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  41.01 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  42.4 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  43.06 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  39.72 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  48.21 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.95 
 
 		 664 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  43.78 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  46.43 
 
 		 455 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  39.01 
 
 		 388 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  45.5 
 
 		 272 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  43.26 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.08 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  42.45 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 233 aa  161  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  47.69 
 
 		 253 aa  161  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  42.6 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  43.38 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  38.53 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  45.96 
 
 		 227 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  40 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>