More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1542 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  98.67 
 
 		 226 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  92.86 
 
 		 229 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  72.81 
 
 		 218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  68.2 
 
 		 218 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  65.44 
 
 		 219 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  67.13 
 
 		 218 aa  278  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  67.57 
 
 		 255 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  68.66 
 
 		 229 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  63.89 
 
 		 221 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  65.74 
 
 		 217 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  63.43 
 
 		 221 aa  264  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  68.06 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  68.66 
 
 		 217 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  61.67 
 
 		 227 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  62.96 
 
 		 221 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  63.13 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  61.29 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  63.89 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  61.09 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  60.83 
 
 		 217 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  53.24 
 
 		 220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  49.33 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  49.33 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  48.89 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  49.53 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  49.29 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  48.34 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  48.34 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  47.87 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  43.46 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  45.87 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  46.45 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  42.59 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  44.91 
 
 		 244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  46.61 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  47.78 
 
 		 236 aa  181  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44.7 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.45 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  45.79 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  46.36 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  41.7 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  45.45 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  43.32 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 		 228 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 		 227 aa  177  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  50.91 
 
 		 242 aa  177  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  42.47 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 253 aa  177  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 253 aa  177  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  46.08 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  45 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.44 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  49.01 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  42.53 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  48.02 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  45.79 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 253 aa  174  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2109  Sigma 54 interacting domain protein  45.41 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.01 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  44.81 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.34 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  47 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1272  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.7 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  43.6 
 
 		 455 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.15 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  44.5 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.15 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 271 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  39.91 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.48 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  46.15 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  44.04 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  46.61 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  45.13 
 
 		 233 aa  171  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  43.84 
 
 		 236 aa  172  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  43.98 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3459  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 258 aa  171  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  46.12 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  43.13 
 
 		 264 aa  171  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  47.89 
 
 		 268 aa  170  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2085  ABC transporter related  48.4 
 
 		 244 aa  170  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  45.69 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1273  ABC transporter, ATPase subunit  46.86 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  42.13 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  39.91 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  46.54 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>