More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0627 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  100 
 
 		 222 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  67.14 
 
 		 223 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  66.67 
 
 		 236 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  66.67 
 
 		 236 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  66.2 
 
 		 236 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  66.97 
 
 		 234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  66.2 
 
 		 236 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  65.14 
 
 		 223 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  65.14 
 
 		 223 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  65.14 
 
 		 223 aa  305  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  64.86 
 
 		 222 aa  305  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  64.68 
 
 		 223 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  65 
 
 		 221 aa  298  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  59.46 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  58.64 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  60.8 
 
 		 221 aa  255  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  48.85 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.37 
 
 		 218 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  47.55 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  47.47 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  47.2 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  43.58 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  42.08 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  46.19 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  42.59 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1387  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.69 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  44.22 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  43.13 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  45.45 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  43.69 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  46.19 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  41.01 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  43.32 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  42.2 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  46.08 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  40.62 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 345 aa  166  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  40.09 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  42.86 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  38.74 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 256 aa  165  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  42.01 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 256 aa  164  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  39.55 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  38.91 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  38.01 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  38.91 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  45.05 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  40.89 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  39.44 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  37.1 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  39.11 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  38.29 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  38.14 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  38.36 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  44.67 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  40.83 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  39.34 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  38.84 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  36.94 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  37.21 
 
 		 604 aa  159  4e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  39.34 
 
 		 258 aa  158  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  43.22 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  39.29 
 
 		 258 aa  157  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  39.63 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  38.12 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  37.79 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  35.78 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3710  ABC transporter foramino acid ATP-binding protein  40.18 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  42.29 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  38.57 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>