More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0713 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  100 
 
 		 223 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  99.55 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  98.65 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  94.17 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  80.72 
 
 		 223 aa  377  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  81.19 
 
 		 236 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  81.19 
 
 		 236 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  80.73 
 
 		 236 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  80.73 
 
 		 236 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  65.14 
 
 		 222 aa  305  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  67.76 
 
 		 221 aa  300  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  68.87 
 
 		 222 aa  298  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  63.72 
 
 		 234 aa  293  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  61.44 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  60.45 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  60.87 
 
 		 244 aa  261  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  50 
 
 		 217 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  49.76 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  49.08 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.39 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  48.57 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  48.34 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  49.31 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  47.39 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  48.08 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  50 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  49.52 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.39 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  48.34 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  43.27 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  51.79 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  45.97 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  42.72 
 
 		 250 aa  177  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  41.18 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  44.44 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  44.39 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 256 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  41.78 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 256 aa  174  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  41.79 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  41.79 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  39.52 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  48.34 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  47.57 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 345 aa  171  5e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  42.29 
 
 		 256 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 256 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  40 
 
 		 239 aa  171  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  47.87 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  41.01 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  47.15 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  46.77 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  41.47 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  45.89 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  43.6 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  44.22 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01332  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  43.75 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  36.41 
 
 		 604 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  42.38 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 279 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  41.26 
 
 		 229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  42.79 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  44.39 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  40.49 
 
 		 455 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  42.79 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  39.17 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  34.98 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  41.87 
 
 		 1090 aa  163  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  40.69 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  42.66 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  43.6 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>