More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6284 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  71.43 
 
 		 229 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  65.6 
 
 		 219 aa  292  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  72.81 
 
 		 226 aa  285  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  72.81 
 
 		 226 aa  284  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  65.75 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  64.68 
 
 		 229 aa  264  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  62.04 
 
 		 218 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  63.89 
 
 		 222 aa  255  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  60.66 
 
 		 227 aa  254  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  60.47 
 
 		 255 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  57.41 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  59.45 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  62.21 
 
 		 217 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  56.94 
 
 		 221 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  59.24 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  57.41 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  56.94 
 
 		 217 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  58.29 
 
 		 222 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  59.91 
 
 		 230 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  55.07 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  55.09 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  47.93 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  47.93 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  47.47 
 
 		 236 aa  197  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  47.47 
 
 		 236 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  47.39 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  47.39 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  46.92 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  44.34 
 
 		 234 aa  191  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  45.37 
 
 		 222 aa  188  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  45.5 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  44.44 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  47.87 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  49.55 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  43.52 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  44.08 
 
 		 264 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  47.37 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  43.52 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  49.09 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  44.5 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.17 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  44.98 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0060  ABC transporter related  45.96 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.235651  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  45.07 
 
 		 271 aa  175  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  47.47 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 242 aa  174  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  44.98 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  43.06 
 
 		 455 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  45.16 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  47.17 
 
 		 268 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  42.13 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  46.34 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  45.16 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  46.34 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  41.47 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  44.04 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  46.27 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  45.16 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 		 228 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  44.7 
 
 		 237 aa  171  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  43.6 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  45.16 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  45.62 
 
 		 221 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 		 345 aa  170  1e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  43.13 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 243 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  45.91 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.73 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  42.4 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.6 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  39.45 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  42.65 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  44.78 
 
 		 258 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  43.58 
 
 		 240 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2109  Sigma 54 interacting domain protein  44.24 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.6 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.6 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  41.92 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  44.55 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  42.24 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  42.92 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  46.73 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.97 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  51.79 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>