More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0257 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  100 
 
 
222 aa  427  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.89 
 
 
218 aa  269  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  64.35 
 
 
229 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  61.57 
 
 
218 aa  262  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  58.33 
 
 
219 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  60.19 
 
 
227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  64.35 
 
 
226 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  63.89 
 
 
226 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  62.96 
 
 
229 aa  248  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  62.15 
 
 
255 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  60.75 
 
 
217 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  58.8 
 
 
222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  57.87 
 
 
221 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 
221 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  58.8 
 
 
222 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  58.26 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  57.48 
 
 
221 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  58.72 
 
 
236 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  60.75 
 
 
217 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  62.62 
 
 
230 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  55.09 
 
 
220 aa  224  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  57.41 
 
 
217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
250 aa  198  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  51.79 
 
 
223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  51.79 
 
 
223 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 
223 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  51.28 
 
 
223 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  47.72 
 
 
243 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.95 
 
 
225 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  47.44 
 
 
236 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  47.44 
 
 
236 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  46.98 
 
 
236 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  46.98 
 
 
236 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  49.08 
 
 
229 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  47.3 
 
 
228 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  48.62 
 
 
235 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
242 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  45.45 
 
 
222 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  47.51 
 
 
227 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  45.45 
 
 
234 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  42.73 
 
 
233 aa  185  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  45 
 
 
244 aa  185  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
225 aa  185  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 
408 aa  185  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
246 aa  185  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 
222 aa  184  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.12 
 
 
230 aa  184  8e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  43.64 
 
 
238 aa  184  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  46.08 
 
 
237 aa  183  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  47.51 
 
 
228 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  49.25 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  49.77 
 
 
261 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  41.1 
 
 
235 aa  182  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.78 
 
 
229 aa  182  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  42.34 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  47 
 
 
233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  43.58 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  45.25 
 
 
248 aa  181  8.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  45.62 
 
 
226 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  48.43 
 
 
227 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  44.5 
 
 
228 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  50.48 
 
 
227 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 
227 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  43.98 
 
 
249 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  47.26 
 
 
237 aa  180  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 
227 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
227 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  45.41 
 
 
269 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  46.85 
 
 
247 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  46.33 
 
 
255 aa  179  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  46.61 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 
240 aa  179  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  46.23 
 
 
244 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  40.64 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  43.95 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  44.39 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  41.89 
 
 
388 aa  178  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  42.59 
 
 
249 aa  178  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  44.39 
 
 
229 aa  178  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 
223 aa  178  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  49.07 
 
 
239 aa  177  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  43.44 
 
 
230 aa  177  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  46.64 
 
 
277 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  38.36 
 
 
604 aa  177  1e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
238 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  49.55 
 
 
227 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  47.2 
 
 
221 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  44.34 
 
 
235 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
238 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
238 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
238 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  47.71 
 
 
223 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  45.29 
 
 
233 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  44.34 
 
 
229 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 
258 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
271 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
224 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
238 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  43.52 
 
 
227 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.556988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>