More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0556 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  66.97 
 
 		 222 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  65.49 
 
 		 223 aa  305  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  64.6 
 
 		 223 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  64.41 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  64.41 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  64.41 
 
 		 236 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  64.41 
 
 		 236 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  63.72 
 
 		 223 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  63.72 
 
 		 223 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  63.27 
 
 		 223 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  60.73 
 
 		 221 aa  270  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  61.11 
 
 		 222 aa  267  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  57.45 
 
 		 243 aa  264  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  57.59 
 
 		 250 aa  264  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  59.91 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  58.71 
 
 		 221 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  48.42 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.66 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.34 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  45.75 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  48.57 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  43.72 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  44.24 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  43.87 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  44.55 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  42.08 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  42.65 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  44.09 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  38.6 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  44.81 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  42.79 
 
 		 220 aa  168  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  39.64 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  42.13 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  39.25 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  42.72 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 250 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  37.99 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  40.91 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 		 250 aa  164  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.61 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  40 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  43.64 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  38.57 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  39.61 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01332  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  41.26 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  42.08 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  44.83 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  36.59 
 
 		 885 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  41.51 
 
 		 217 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  38.29 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.18 
 
 		 664 aa  158  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  41.18 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  40.44 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  38.5 
 
 		 643 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  40.09 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  38.67 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  35.43 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  40.74 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  38.65 
 
 		 274 aa  156  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  40.28 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  39.73 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  43.06 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  37.5 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  37.21 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  39.46 
 
 		 241 aa  154  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  40 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  31.78 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  38.01 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  36.68 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  37.32 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  40.58 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 345 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  37.17 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>