More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0748 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  100 
 
 		 664 aa  1336    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  51.86 
 
 		 662 aa  628  1e-178  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  51.04 
 
 		 660 aa  604  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  48.73 
 
 		 664 aa  574  1.0000000000000001e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 643 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  32.57 
 
 		 652 aa  277  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  32.55 
 
 		 642 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  31.01 
 
 		 671 aa  266  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  32.22 
 
 		 652 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  30.11 
 
 		 668 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  30.85 
 
 		 653 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  30.64 
 
 		 653 aa  263  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.51 
 
 		 648 aa  260  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  28.69 
 
 		 696 aa  259  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  29.23 
 
 		 644 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.98 
 
 		 647 aa  253  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.06 
 
 		 646 aa  253  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  28.93 
 
 		 648 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  28.93 
 
 		 648 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  31.24 
 
 		 656 aa  253  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  30.19 
 
 		 647 aa  251  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30 
 
 		 649 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.71 
 
 		 649 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  51.67 
 
 		 1130 aa  248  3e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  29.32 
 
 		 654 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  30.29 
 
 		 652 aa  247  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  30.5 
 
 		 656 aa  247  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  30.01 
 
 		 667 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  30.13 
 
 		 667 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.8 
 
 		 656 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.07 
 
 		 642 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  35.71 
 
 		 779 aa  245  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  32.23 
 
 		 652 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  31.44 
 
 		 641 aa  244  3.9999999999999997e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.77 
 
 		 648 aa  243  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  29.43 
 
 		 661 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  30.65 
 
 		 648 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  30.65 
 
 		 648 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  29.33 
 
 		 646 aa  243  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.52 
 
 		 648 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  30.65 
 
 		 648 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.65 
 
 		 648 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.65 
 
 		 648 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.65 
 
 		 648 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  30.66 
 
 		 650 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  30.67 
 
 		 663 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  29.26 
 
 		 682 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  30.47 
 
 		 663 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  30.8 
 
 		 653 aa  239  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  29.58 
 
 		 657 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  28.61 
 
 		 654 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  41.46 
 
 		 779 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  30.4 
 
 		 668 aa  238  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  30.26 
 
 		 657 aa  236  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  30.96 
 
 		 647 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  29.15 
 
 		 643 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  29.03 
 
 		 682 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  29.06 
 
 		 657 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  43.39 
 
 		 1090 aa  234  4.0000000000000004e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  28.38 
 
 		 648 aa  234  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.66 
 
 		 658 aa  234  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  35.7 
 
 		 888 aa  233  6e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  29.41 
 
 		 654 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  29.6 
 
 		 678 aa  232  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  30.57 
 
 		 643 aa  230  5e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  29.15 
 
 		 678 aa  230  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  29.39 
 
 		 657 aa  230  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.15 
 
 		 678 aa  230  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.26 
 
 		 640 aa  229  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  29.91 
 
 		 655 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  28.43 
 
 		 657 aa  225  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  29.53 
 
 		 645 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  29.67 
 
 		 654 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  48.47 
 
 		 903 aa  223  9e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  28.47 
 
 		 666 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  28.65 
 
 		 668 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  28.65 
 
 		 668 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  38.29 
 
 		 950 aa  221  5e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.22 
 
 		 1207 aa  220  7e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  28.78 
 
 		 641 aa  219  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  28.82 
 
 		 656 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  28.91 
 
 		 660 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  48.42 
 
 		 230 aa  219  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  29.4 
 
 		 654 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2115  ABC transporter related  28.97 
 
 		 647 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  28.78 
 
 		 641 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  28.74 
 
 		 641 aa  217  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  29.12 
 
 		 670 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.22 
 
 		 230 aa  217  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.53 
 
 		 226 aa  215  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  40.76 
 
 		 715 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  47.6 
 
 		 885 aa  213  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.42 
 
 		 232 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  49.33 
 
 		 237 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  46.58 
 
 		 224 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 233 aa  211  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  26.99 
 
 		 707 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.51 
 
 		 239 aa  210  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.4 
 
 		 237 aa  210  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  38.12 
 
 		 651 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>