More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1852 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
250 aa  505  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  45.63 
 
 
237 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  51.22 
 
 
228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  47.52 
 
 
253 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  47.33 
 
 
249 aa  234  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  49.17 
 
 
244 aa  228  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  46.5 
 
 
237 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  46.5 
 
 
237 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 
236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.53 
 
 
229 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2377  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2086  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  45.49 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1113  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1392  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  48.1 
 
 
228 aa  219  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.08 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 
233 aa  215  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  44.58 
 
 
228 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  43.98 
 
 
228 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  41.08 
 
 
239 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1950  ABC transporter related  43.21 
 
 
238 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458128  normal  0.0230529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  39.67 
 
 
226 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  40.08 
 
 
226 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
226 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
246 aa  201  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 
226 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  44.49 
 
 
227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
226 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  39.58 
 
 
230 aa  198  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  42.98 
 
 
249 aa  198  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  41.15 
 
 
222 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  42.98 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  41.74 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  39.51 
 
 
243 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  39.83 
 
 
231 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  42.32 
 
 
244 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  40.74 
 
 
230 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  38.27 
 
 
225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  40.91 
 
 
231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  41.22 
 
 
227 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  40.49 
 
 
237 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  42.32 
 
 
249 aa  195  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  40.41 
 
 
227 aa  195  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  40.16 
 
 
229 aa  194  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
221 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  41.56 
 
 
228 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  42.62 
 
 
227 aa  193  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  41.87 
 
 
235 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  45.49 
 
 
232 aa  193  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.15 
 
 
250 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.32 
 
 
237 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  39 
 
 
229 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
246 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.39 
 
 
227 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  40.91 
 
 
234 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  38.68 
 
 
240 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  40.91 
 
 
234 aa  192  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  41.56 
 
 
237 aa  191  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  43.85 
 
 
223 aa  191  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 
228 aa  191  9e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  39.09 
 
 
255 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  39.34 
 
 
235 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
227 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  40.74 
 
 
238 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  41.15 
 
 
230 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  40.42 
 
 
240 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  39.18 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  38.84 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  40 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  40 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  40.65 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  41.49 
 
 
223 aa  189  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
319 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  40.16 
 
 
228 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  38.37 
 
 
236 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  40.57 
 
 
230 aa  188  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  43.22 
 
 
234 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  40.82 
 
 
240 aa  188  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
241 aa  188  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  39.51 
 
 
238 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 
229 aa  187  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  38.27 
 
 
233 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  39 
 
 
225 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  40.82 
 
 
227 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  38.84 
 
 
225 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  39.52 
 
 
254 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>